226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH00420 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  100 
 
 		 892 aa  1837    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  31.45 
 
 		 1015 aa  242  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  27.67 
 
 		 993 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  26.16 
 
 		 725 aa  191  7e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  43.1 
 
 		 235 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  25.96 
 
 		 413 aa  138  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  29.24 
 
 		 1001 aa  128  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  27.94 
 
 		 437 aa  127  8.000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  29.07 
 
 		 484 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  29.18 
 
 		 474 aa  127  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  26.09 
 
 		 422 aa  127  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  29.07 
 
 		 484 aa  127  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  29.07 
 
 		 482 aa  127  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  25.61 
 
 		 423 aa  125  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  25 
 
 		 422 aa  124  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  26.36 
 
 		 498 aa  124  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  25.88 
 
 		 421 aa  121  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  30.45 
 
 		 942 aa  119  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  24.9 
 
 		 514 aa  118  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  28.08 
 
 		 1092 aa  118  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  29.02 
 
 		 405 aa  117  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  26.32 
 
 		 497 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  24.54 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  27.52 
 
 		 492 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  26.33 
 
 		 764 aa  114  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  28.34 
 
 		 467 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  27.86 
 
 		 443 aa  110  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  26.9 
 
 		 497 aa  109  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  25.71 
 
 		 454 aa  109  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  25.07 
 
 		 385 aa  107  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  28.21 
 
 		 500 aa  106  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  25 
 
 		 507 aa  105  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  29.1 
 
 		 481 aa  102  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  27.05 
 
 		 476 aa  101  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  26.22 
 
 		 483 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  23.77 
 
 		 497 aa  99.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  28.98 
 
 		 451 aa  97.8  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  25.2 
 
 		 642 aa  97.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  25.95 
 
 		 319 aa  87.4  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  25.44 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  26.62 
 
 		 320 aa  86.3  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  28 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  28.57 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  24 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  26.18 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  25.46 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  25.52 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  25.77 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8086  predicted protein  34.75 
 
 		 114 aa  75.1  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  24.62 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  25 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  25 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  25.09 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  25 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  24.24 
 
 		 347 aa  73.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  24 
 
 		 348 aa  73.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  24.25 
 
 		 329 aa  73.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  26.27 
 
 		 328 aa  73.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  26.22 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  25.2 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  23.48 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  25.48 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  24.07 
 
 		 330 aa  70.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  25.65 
 
 		 322 aa  70.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  25.43 
 
 		 334 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  25.88 
 
 		 322 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  24.8 
 
 		 326 aa  69.7  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  25.9 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  26.1 
 
 		 289 aa  66.6  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  25.2 
 
 		 325 aa  66.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  23.11 
 
 		 326 aa  67  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  23.33 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  24.25 
 
 		 318 aa  66.2  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  26.2 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  24.63 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  25.19 
 
 		 398 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  27.81 
 
 		 305 aa  63.9  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  26.04 
 
 		 350 aa  64.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15652  predicted protein  23.36 
 
 		 894 aa  62.4  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  29.5 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  24.91 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  24.43 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  22.44 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0681  AAA ATPase central domain protein  28.98 
 
 		 567 aa  60.1  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00704471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  24.8 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31554  replication factor ATPase  25.67 
 
 		 786 aa  58.5  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000494738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  23.62 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  25.29 
 
 		 387 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.34 
 
 		 460 aa  53.9  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  28.77 
 
 		 783 aa  53.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  27.96 
 
 		 455 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43936  predicted protein  23.8 
 
 		 1223 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  27.36 
 
 		 735 aa  52  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  41.33 
 
 		 427 aa  52  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  29.65 
 
 		 733 aa  51.6  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  23.18 
 
 		 795 aa  51.6  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  28.3 
 
 		 451 aa  51.2  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  25 
 
 		 461 aa  51.2  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  25.27 
 
 		 450 aa  51.2  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.56 
 
 		 634 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.720575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>