More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0991 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0991  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 429 aa  886    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  40.61 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  39.01 
 
 		 430 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  37.59 
 
 		 428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  39.3 
 
 		 422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  39.15 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  37.35 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  37.35 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  37.35 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  37.23 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  37.11 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  37.11 
 
 		 428 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  37.74 
 
 		 432 aa  270  5e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  36.99 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  36.87 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  38.85 
 
 		 419 aa  266  5e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  36.87 
 
 		 428 aa  265  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  36.87 
 
 		 428 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  37.12 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  38.37 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  35.63 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  35.63 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  34.68 
 
 		 423 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  37.56 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  34.77 
 
 		 441 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  34.6 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0186  recombination factor protein RarA  33.25 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  33.96 
 
 		 443 aa  226  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  35.46 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  34.71 
 
 		 415 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  32.63 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  32.31 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  33.42 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  32.12 
 
 		 447 aa  219  8.999999999999998e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  32.93 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  32.93 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  33.58 
 
 		 485 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  32.69 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  33.57 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  32.77 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  32.62 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  33.01 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  34.61 
 
 		 432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  32.29 
 
 		 519 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  32.04 
 
 		 410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  32.41 
 
 		 444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  33.67 
 
 		 425 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  34.5 
 
 		 432 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  33.33 
 
 		 437 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  33.66 
 
 		 457 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf175  recombination factor protein RarA  32.93 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  33.09 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  32.56 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  33.49 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  33.42 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  31.4 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  33.41 
 
 		 739 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  34.04 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  32.79 
 
 		 426 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  33.97 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  32.24 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  34.22 
 
 		 440 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  32.49 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  33.1 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  32.84 
 
 		 420 aa  206  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  29.65 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  31.37 
 
 		 447 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  33.5 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  32.14 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  32.68 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  32.14 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  33.96 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  30 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  32.55 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  31.7 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  32.15 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  32.18 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  31.93 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  32.39 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  30.09 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  32.55 
 
 		 455 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1168  recombination factor protein RarA  32.93 
 
 		 407 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  33.64 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  31.37 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  32.78 
 
 		 735 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  31.69 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  31.97 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  31.68 
 
 		 443 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  31.41 
 
 		 494 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  30.7 
 
 		 461 aa  199  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  32.92 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  31.11 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  31.57 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  31.11 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  31.11 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  32.27 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  32.31 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  32.31 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  32.81 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  32.31 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>