More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2375 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 463 aa  926    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  68.37 
 
 		 463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  64.71 
 
 		 484 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  65.54 
 
 		 436 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  64.72 
 
 		 436 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  64.8 
 
 		 456 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  61.28 
 
 		 461 aa  531  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  66.75 
 
 		 456 aa  521  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  61.86 
 
 		 429 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  62.89 
 
 		 445 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  62.86 
 
 		 448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  61.63 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  63.59 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  62.92 
 
 		 478 aa  512  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  63.51 
 
 		 441 aa  511  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  60.97 
 
 		 456 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  62.05 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  58.46 
 
 		 519 aa  501  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  65.28 
 
 		 456 aa  501  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  63.35 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  61 
 
 		 502 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  59.95 
 
 		 494 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  61.4 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  61.4 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  58.73 
 
 		 490 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  61.4 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  60.14 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  61.78 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  60.13 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  60.05 
 
 		 477 aa  481  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  61.1 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  61.43 
 
 		 452 aa  475  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  62.15 
 
 		 460 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  61.89 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  61.28 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  52.09 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  62.88 
 
 		 499 aa  433  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  52.97 
 
 		 459 aa  428  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  49.07 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  51.26 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.76 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  46.88 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  50.6 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  47.54 
 
 		 440 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  47.45 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  46.73 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  48.74 
 
 		 432 aa  395  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  48.84 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  48.32 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.16 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  48.48 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  47.53 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  47.15 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  47.9 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  47.55 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  49.88 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  46.79 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  46.01 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  47.8 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  46.39 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  44.16 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  44.16 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  46.88 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  46.26 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  46.7 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  45.56 
 
 		 451 aa  363  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 		 428 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  45.92 
 
 		 428 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  46.37 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  48.8 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  45.92 
 
 		 428 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  43.39 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  46.03 
 
 		 428 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  46.03 
 
 		 428 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  44.32 
 
 		 439 aa  360  4e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  44.14 
 
 		 440 aa  360  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  43.94 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 		 428 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  47.94 
 
 		 505 aa  359  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  45.69 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  45.69 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  44.52 
 
 		 447 aa  359  7e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  46.94 
 
 		 459 aa  356  5e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  47.64 
 
 		 423 aa  356  5e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  47.33 
 
 		 458 aa  356  5e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.88 
 
 		 731 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  46.38 
 
 		 434 aa  355  6.999999999999999e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  43.56 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  46.62 
 
 		 453 aa  354  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  43.78 
 
 		 463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  44.74 
 
 		 447 aa  353  5e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.39 
 
 		 726 aa  352  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  44.63 
 
 		 444 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 426 aa  351  2e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  47.1 
 
 		 434 aa  351  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>