More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl403 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 410 aa  841    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  62.59 
 
 		 412 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  42.24 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  42.48 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  42.72 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  42.72 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  42.24 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  42.48 
 
 		 428 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  42.48 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  42 
 
 		 428 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  41.29 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  42 
 
 		 428 aa  355  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  41.53 
 
 		 428 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0186  recombination factor protein RarA  45.88 
 
 		 408 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  41.59 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  40.62 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  42.86 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  41.37 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf175  recombination factor protein RarA  43.03 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  39.81 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  39.81 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  39.28 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  41.43 
 
 		 430 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  40.8 
 
 		 431 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  39.39 
 
 		 422 aa  310  4e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  34.13 
 
 		 429 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  32.94 
 
 		 445 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  32.94 
 
 		 445 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  32.94 
 
 		 445 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  33.73 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  38.41 
 
 		 415 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  35.56 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  36.17 
 
 		 444 aa  260  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  33.82 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  33.89 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  36.32 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  34.05 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  35.18 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  34.16 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  38.02 
 
 		 441 aa  249  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  34.7 
 
 		 731 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  34.4 
 
 		 441 aa  249  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  34.57 
 
 		 447 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  35.47 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  33.01 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  36.83 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  38.59 
 
 		 408 aa  245  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  37.05 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.38 
 
 		 739 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  34.14 
 
 		 500 aa  243  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  34.05 
 
 		 448 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  34.14 
 
 		 432 aa  242  9e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  33.33 
 
 		 435 aa  242  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.61 
 
 		 734 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.9 
 
 		 726 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  34.31 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  32.62 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.61 
 
 		 734 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  32.86 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  31.01 
 
 		 519 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  32.46 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  34.49 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  33.02 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  35.15 
 
 		 443 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  33.66 
 
 		 447 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  34.24 
 
 		 735 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  30.86 
 
 		 494 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  31.65 
 
 		 447 aa  236  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  33.82 
 
 		 422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  32.94 
 
 		 441 aa  236  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  33.26 
 
 		 455 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  32.43 
 
 		 477 aa  232  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  34.3 
 
 		 458 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  34.41 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  31.76 
 
 		 448 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  31.03 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  34.06 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  33.09 
 
 		 502 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  32.54 
 
 		 456 aa  230  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  32.77 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  34.73 
 
 		 721 aa  230  4e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  33.81 
 
 		 463 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  33.5 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  34.49 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  34.31 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  35.65 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  34.59 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  32.67 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  32.2 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  33.82 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  34.34 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  34.07 
 
 		 733 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  31.12 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  31.26 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  34.01 
 
 		 446 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  33.5 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  35.18 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  35.64 
 
 		 437 aa  226  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>