More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0515 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 412 aa  835    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  62.59 
 
 		 410 aa  540  9.999999999999999e-153  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0186  recombination factor protein RarA  47.01 
 
 		 408 aa  361  1e-98  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  40.1 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  39.57 
 
 		 428 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  39.57 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  39.34 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  40.28 
 
 		 428 aa  330  4e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  39.57 
 
 		 428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  39.57 
 
 		 428 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf175  recombination factor protein RarA  44.12 
 
 		 402 aa  328  9e-89  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  39.72 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  39.34 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  39.34 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  39.1 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  39.1 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  40.81 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  41.13 
 
 		 430 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  40.14 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  40.14 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  39.05 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  42.16 
 
 		 419 aa  319  3.9999999999999996e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  41.18 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  40.2 
 
 		 422 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  38.95 
 
 		 431 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  38.79 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  39.95 
 
 		 432 aa  279  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  40.84 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  39.38 
 
 		 441 aa  270  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  35.14 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  36.54 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  35.39 
 
 		 435 aa  269  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  38.59 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  36.53 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  37.44 
 
 		 450 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.92 
 
 		 731 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  33.89 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  35.24 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  34.19 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1401  recombination factor protein RarA  34.87 
 
 		 411 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  33.89 
 
 		 432 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  34.75 
 
 		 440 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  34.13 
 
 		 441 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  33.57 
 
 		 432 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  33.49 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  35.8 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  33.49 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  33.49 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  34.2 
 
 		 463 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0339  recombination factor protein RarA  34.62 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1168  recombination factor protein RarA  35.27 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.33 
 
 		 726 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  35.25 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  35.63 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  34.29 
 
 		 436 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  32.85 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  37.21 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  36.34 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1564  recombination factor protein RarA  35.75 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  33.49 
 
 		 456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  33.66 
 
 		 500 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  34.92 
 
 		 439 aa  245  9e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.51 
 
 		 735 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.68 
 
 		 734 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  36.14 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.68 
 
 		 734 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1853  recombination factor protein RarA  36.67 
 
 		 430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  35.44 
 
 		 436 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.65 
 
 		 721 aa  242  7e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  33.5 
 
 		 447 aa  242  9e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  36.36 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.42 
 
 		 733 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  33.49 
 
 		 447 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  35.19 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  35.19 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  33.57 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  35.37 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  35.37 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  35.76 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  33.17 
 
 		 448 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  34.77 
 
 		 436 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  34.71 
 
 		 434 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  34.59 
 
 		 739 aa  239  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  34.47 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  34.4 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  36.53 
 
 		 429 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  37.29 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  31.82 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  34.74 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  36.66 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>