More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1853 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1853  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 430 aa  872    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1564  recombination factor protein RarA  70.1 
 
 		 404 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1401  recombination factor protein RarA  65.26 
 
 		 411 aa  541  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0339  recombination factor protein RarA  63.7 
 
 		 408 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1168  recombination factor protein RarA  65.57 
 
 		 407 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1998  recombination factor protein RarA  66.67 
 
 		 375 aa  521  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.805499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  45.67 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  45.21 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  42.31 
 
 		 450 aa  349  7e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  45.05 
 
 		 448 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  43.03 
 
 		 441 aa  342  8e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  43.56 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 435 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  41.16 
 
 		 447 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  42.65 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  42.03 
 
 		 731 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  43.47 
 
 		 447 aa  325  9e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  46.06 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  42.86 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  42.04 
 
 		 434 aa  322  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  41.9 
 
 		 457 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  42.14 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  40.49 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  42.04 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  43.3 
 
 		 500 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  44.17 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  41.43 
 
 		 485 aa  316  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  42.42 
 
 		 453 aa  316  6e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  41.76 
 
 		 457 aa  315  9e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  41.69 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  44 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  40.67 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  42.27 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  40.85 
 
 		 441 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  40.92 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  43.87 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  43.87 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  42.96 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  42.05 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  40.24 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  43.63 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  41.28 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  41.36 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  39.67 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  42.57 
 
 		 423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  42.09 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  42.34 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  41.44 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  40.28 
 
 		 423 aa  307  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  43.8 
 
 		 432 aa  307  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  42.09 
 
 		 505 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  40.42 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  39.56 
 
 		 432 aa  306  6e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  41.63 
 
 		 458 aa  306  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  39.63 
 
 		 438 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  41.31 
 
 		 431 aa  305  8.000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  41.4 
 
 		 440 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  41.63 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  41.86 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05617  DNA replication ATPase (Eurofung)  41.79 
 
 		 528 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00143305  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  41.53 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  40.53 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  40.78 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  43.3 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  41.09 
 
 		 429 aa  304  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  40.38 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  39.95 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  41.01 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  41.33 
 
 		 457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  41.09 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  41.71 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  42.03 
 
 		 447 aa  303  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  38.08 
 
 		 432 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  39.5 
 
 		 462 aa  302  6.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  41.01 
 
 		 441 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  40.78 
 
 		 441 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  39.62 
 
 		 739 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  41.25 
 
 		 435 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  39.58 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  39.8 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  43.5 
 
 		 444 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.29 
 
 		 734 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  41.99 
 
 		 422 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 441 aa  298  8e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  42.02 
 
 		 445 aa  299  8e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  43.86 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.05 
 
 		 734 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  39.43 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  39.13 
 
 		 726 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  40.43 
 
 		 436 aa  296  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  38.88 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.73 
 
 		 733 aa  296  4e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  40.88 
 
 		 439 aa  296  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  39.42 
 
 		 735 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.44 
 
 		 599 aa  295  7e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  39.86 
 
 		 447 aa  295  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  40.42 
 
 		 459 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>