More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1564 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1564  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 404 aa  818    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1853  recombination factor protein RarA  70.1 
 
 		 430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1168  recombination factor protein RarA  68.17 
 
 		 407 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1401  recombination factor protein RarA  68.19 
 
 		 411 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0339  recombination factor protein RarA  64.82 
 
 		 408 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1998  recombination factor protein RarA  69.89 
 
 		 375 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.805499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  46.9 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  46.67 
 
 		 435 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 		 447 aa  346  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  45.71 
 
 		 448 aa  346  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  44.47 
 
 		 434 aa  345  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  45.34 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  41.41 
 
 		 450 aa  344  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  43.74 
 
 		 435 aa  344  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  45.19 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  44.24 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  44.05 
 
 		 457 aa  335  7.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.31 
 
 		 731 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  43.81 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  43.57 
 
 		 457 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  43.6 
 
 		 441 aa  332  5e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  42.82 
 
 		 463 aa  332  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  44.58 
 
 		 457 aa  330  4e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  42.18 
 
 		 447 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  41.35 
 
 		 443 aa  328  8e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  44.58 
 
 		 434 aa  328  9e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  43.63 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  44.99 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  43.41 
 
 		 453 aa  325  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  41.04 
 
 		 447 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  45.72 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  41.63 
 
 		 441 aa  322  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  43.41 
 
 		 441 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  43.41 
 
 		 441 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  43.78 
 
 		 423 aa  322  7e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  42.09 
 
 		 438 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  41.65 
 
 		 440 aa  322  8e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  43.17 
 
 		 430 aa  322  9.000000000000001e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  45.65 
 
 		 442 aa  322  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  44.58 
 
 		 447 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  41 
 
 		 445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  44.18 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  44.44 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  42.65 
 
 		 420 aa  319  6e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  44.01 
 
 		 443 aa  319  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  43.63 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  42.55 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  42.55 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  42.55 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  42.55 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  42.55 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  42.55 
 
 		 455 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  42.55 
 
 		 436 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  45.84 
 
 		 429 aa  316  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 449 aa  316  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  41.71 
 
 		 437 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  42.3 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  42.55 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  42.34 
 
 		 449 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  43.2 
 
 		 446 aa  315  9e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  43.74 
 
 		 505 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  43.9 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  43.23 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  41.95 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  43.41 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  43.29 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  41.77 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  41.63 
 
 		 446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  41.22 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  42.45 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  43.78 
 
 		 436 aa  312  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  43.41 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  43.66 
 
 		 440 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  43.25 
 
 		 458 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  40.8 
 
 		 441 aa  312  5.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  41.3 
 
 		 431 aa  312  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  40.92 
 
 		 437 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  41.77 
 
 		 425 aa  311  9e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  42.99 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  41.4 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  43.89 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  42.07 
 
 		 461 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  43.41 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  42.59 
 
 		 439 aa  310  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  42.65 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  41.95 
 
 		 441 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  45.11 
 
 		 425 aa  309  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  42.52 
 
 		 443 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 444 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  42.44 
 
 		 441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  43.35 
 
 		 423 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  41.71 
 
 		 441 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 451 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  42.65 
 
 		 419 aa  309  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  42.99 
 
 		 445 aa  308  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.62 
 
 		 734 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  44.78 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  40.62 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  40.91 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>