More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0339 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0339  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 408 aa  833    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1401  recombination factor protein RarA  80.54 
 
 		 411 aa  688    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1168  recombination factor protein RarA  72.52 
 
 		 407 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1998  recombination factor protein RarA  76.1 
 
 		 375 aa  599  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.805499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1853  recombination factor protein RarA  63.7 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1564  recombination factor protein RarA  64.82 
 
 		 404 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  45.84 
 
 		 432 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  44.29 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 		 440 aa  345  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  44.79 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 		 441 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  45.5 
 
 		 448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  43.95 
 
 		 463 aa  338  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  44.66 
 
 		 434 aa  338  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  44.79 
 
 		 457 aa  338  8e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  44.66 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  42.23 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  44.63 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  41.69 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  42.17 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  44.79 
 
 		 419 aa  332  7.000000000000001e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  43.84 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  46.3 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  46.3 
 
 		 437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  44.08 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  44.34 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  43.36 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  46.3 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  41.69 
 
 		 447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  46.1 
 
 		 485 aa  325  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  45.61 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  45.13 
 
 		 429 aa  322  9.000000000000001e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  43.44 
 
 		 446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  42.28 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  46.1 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  42.22 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  42.45 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  43.17 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  43 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  44.99 
 
 		 500 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  43.1 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  45.58 
 
 		 444 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  45.16 
 
 		 423 aa  316  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  43.13 
 
 		 449 aa  315  7e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  43.03 
 
 		 443 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  42.04 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  43.22 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  40.63 
 
 		 439 aa  313  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  42.62 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  44.66 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  44.73 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.05 
 
 		 731 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  44.02 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  41.61 
 
 		 447 aa  312  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  41.51 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  42.45 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  42.99 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  40.52 
 
 		 432 aa  310  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  42.39 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  42 
 
 		 429 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  43.63 
 
 		 463 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  45.89 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  42.34 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  44.94 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  42.66 
 
 		 505 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  44.21 
 
 		 447 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  45.65 
 
 		 451 aa  309  5.9999999999999995e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  46.62 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  43.23 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  42.23 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  42.41 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  41.37 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  44.24 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  42.34 
 
 		 443 aa  306  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  42.12 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  40.57 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  40 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  40.94 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  40.94 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  40.38 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  40.94 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  42.12 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  42.89 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  39.52 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  43.02 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  41.27 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  42.55 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  43.2 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  42.18 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  40.47 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  41.12 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  43.02 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  41.67 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  41.27 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  42.32 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.14 
 
 		 734 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  39.72 
 
 		 734 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>