More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf175 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf175  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 402 aa  819    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  42.52 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  40.81 
 
 		 428 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  41.9 
 
 		 428 aa  335  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  42.28 
 
 		 428 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  41.67 
 
 		 428 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  42.28 
 
 		 428 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  41.43 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  41.43 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  41.43 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  43.03 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  40.71 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  41.33 
 
 		 428 aa  329  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  44.12 
 
 		 412 aa  328  9e-89  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  42.51 
 
 		 419 aa  319  5e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0186  recombination factor protein RarA  43.36 
 
 		 408 aa  318  9e-86  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  39.52 
 
 		 428 aa  309  6.999999999999999e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  40.95 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  38.89 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  38.89 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  40.34 
 
 		 422 aa  302  9e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  39.71 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  38.26 
 
 		 434 aa  295  8e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  38.85 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  40.2 
 
 		 432 aa  292  8e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  39.81 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1853  recombination factor protein RarA  38.4 
 
 		 430 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  39.01 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  39.34 
 
 		 441 aa  266  7e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  36.86 
 
 		 437 aa  266  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  35.32 
 
 		 435 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  34.37 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.85 
 
 		 731 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  38.21 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  35.08 
 
 		 435 aa  262  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  35.1 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.2 
 
 		 735 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  37.47 
 
 		 447 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.77 
 
 		 739 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.98 
 
 		 734 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  35.22 
 
 		 440 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  37.62 
 
 		 441 aa  256  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  32.78 
 
 		 448 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.74 
 
 		 734 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  34.83 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1401  recombination factor protein RarA  34.08 
 
 		 411 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  36.84 
 
 		 435 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  33.49 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  37.26 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  33.89 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  34.88 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  36.6 
 
 		 447 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0339  recombination factor protein RarA  33.92 
 
 		 408 aa  249  7e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  34.84 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 463 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  35.36 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  37.86 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.82 
 
 		 726 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.5 
 
 		 721 aa  246  4e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1168  recombination factor protein RarA  33.5 
 
 		 407 aa  246  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  36.94 
 
 		 457 aa  246  6e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  36.53 
 
 		 457 aa  245  9e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  34.48 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.8 
 
 		 733 aa  243  5e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  34.92 
 
 		 461 aa  243  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  34.61 
 
 		 436 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  36.62 
 
 		 457 aa  242  7e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1998  recombination factor protein RarA  35.83 
 
 		 375 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.805499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  37.47 
 
 		 458 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  33.65 
 
 		 485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  37.35 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0658  AAA ATPase central domain protein  33.57 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0721035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1564  recombination factor protein RarA  33.42 
 
 		 404 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  37.08 
 
 		 435 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  34.59 
 
 		 505 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  35.32 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  35.32 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  37.31 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  32.62 
 
 		 440 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  33.57 
 
 		 436 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  34.42 
 
 		 459 aa  236  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  35.32 
 
 		 437 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  34.27 
 
 		 447 aa  236  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  33.33 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  33.73 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  35.04 
 
 		 415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  34.22 
 
 		 451 aa  232  8.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  34.94 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  34.92 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  33.1 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2683  recombination factor protein RarA  33.41 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.826715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2594  recombination factor protein RarA  33.41 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.558915  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1615  recombination factor protein RarA  33.41 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.47 
 
 		 599 aa  230  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.71 
 
 		 599 aa  230  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  35.41 
 
 		 443 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  32.46 
 
 		 441 aa  229  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05617  DNA replication ATPase (Eurofung)  36.78 
 
 		 528 aa  229  8e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00143305  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  36.41 
 
 		 429 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  35.56 
 
 		 423 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>