More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1228 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 432 aa  882    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  65.5 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  64.65 
 
 		 434 aa  558  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  59.53 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  59.53 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  56.94 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  59 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  56.84 
 
 		 428 aa  488  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  57.08 
 
 		 428 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  56.87 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  56.6 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  57.08 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  56.84 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  56.6 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  56.84 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  57.08 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  56.64 
 
 		 428 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  56.16 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  56.5 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  56.87 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  46.28 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  46.01 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  44.93 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  47.42 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  46.49 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  42.25 
 
 		 432 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  44.99 
 
 		 441 aa  348  8e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  43.54 
 
 		 447 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  45.09 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 422 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.92 
 
 		 726 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  43.16 
 
 		 494 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  43.9 
 
 		 463 aa  335  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  42.02 
 
 		 731 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  41.37 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  42.93 
 
 		 739 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  44.88 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  44.39 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  41.63 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  42.68 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  43.28 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  39.68 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  41.36 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  42.05 
 
 		 485 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  40.09 
 
 		 519 aa  323  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  42.55 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  42.09 
 
 		 505 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0186  recombination factor protein RarA  43.81 
 
 		 408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  39.77 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  39.46 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  37.82 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  39.02 
 
 		 446 aa  317  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  40.57 
 
 		 465 aa  317  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  39.9 
 
 		 435 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  40.47 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  39.72 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  38.57 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  37.18 
 
 		 451 aa  312  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.34 
 
 		 735 aa  312  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  38.37 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  40.48 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  41.26 
 
 		 721 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  40.75 
 
 		 415 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  40.59 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  41.32 
 
 		 734 aa  309  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  40.34 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  39.1 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  41.71 
 
 		 734 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  40.34 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  39.25 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.39 
 
 		 733 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  41.28 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  41.55 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  41.71 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  41.09 
 
 		 446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  39.4 
 
 		 436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  40.59 
 
 		 445 aa  303  4.0000000000000003e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  40.18 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  39.9 
 
 		 445 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  39.9 
 
 		 445 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  39.9 
 
 		 445 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  38.79 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  40.09 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  39.17 
 
 		 484 aa  300  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  40.52 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  38.67 
 
 		 544 aa  299  8e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  40.34 
 
 		 420 aa  299  8e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  40.73 
 
 		 446 aa  298  9e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  39.53 
 
 		 436 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  40.33 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  39.58 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  39.95 
 
 		 419 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  38.05 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  39.26 
 
 		 445 aa  295  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  35.19 
 
 		 463 aa  295  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>