More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2319 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 460 aa  894    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  72.95 
 
 		 456 aa  628  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  69.67 
 
 		 446 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  71.86 
 
 		 429 aa  621  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  70.55 
 
 		 445 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  70.55 
 
 		 445 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  70.55 
 
 		 445 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  68.71 
 
 		 452 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  71.46 
 
 		 448 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  65.45 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  72.16 
 
 		 457 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  64.77 
 
 		 445 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  62.01 
 
 		 519 aa  513  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  65.72 
 
 		 456 aa  505  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  63.59 
 
 		 477 aa  501  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  62.72 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  61.52 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  63.08 
 
 		 456 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  61.98 
 
 		 448 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  60.44 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  63.14 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  63.34 
 
 		 502 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  62.63 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  63.55 
 
 		 441 aa  491  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  64.08 
 
 		 465 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  61.57 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  64.75 
 
 		 466 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  61.18 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  63.27 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  59.65 
 
 		 436 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  65.16 
 
 		 473 aa  478  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  60.95 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  59.06 
 
 		 490 aa  478  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  61.24 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  60.41 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  57.11 
 
 		 459 aa  455  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  54.77 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.27 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  51.15 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  52.45 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  61.66 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  49.65 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  51.24 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  49.54 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  51.28 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  47.05 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  48.72 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  47.69 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  47.97 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  46.95 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  47.94 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.25 
 
 		 739 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  47.71 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  47.99 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.78 
 
 		 731 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  47.42 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  44.85 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  46.74 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  49.03 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  45.37 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  49.28 
 
 		 435 aa  375  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  47.2 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  46.93 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  43.93 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  49.04 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  48.69 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  51.79 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  45.33 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  49.29 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.62 
 
 		 726 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 		 444 aa  362  9e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  46.21 
 
 		 451 aa  362  9e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  49.77 
 
 		 447 aa  362  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  43.33 
 
 		 435 aa  360  4e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.6 
 
 		 431 aa  358  8e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  45.07 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.01 
 
 		 734 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.77 
 
 		 734 aa  356  5e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  44.84 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  44.52 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  47.04 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.59 
 
 		 735 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  48.71 
 
 		 505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 437 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 437 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  46.99 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  45.54 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  46.26 
 
 		 447 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  44.13 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  40.8 
 
 		 445 aa  349  6e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  46.26 
 
 		 447 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  46.26 
 
 		 447 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  46.26 
 
 		 447 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  48.34 
 
 		 427 aa  348  8e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  48.59 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  46.79 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  45.71 
 
 		 447 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>