More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3035 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  100 
 
 
456 aa  889    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  72.87 
 
 
474 aa  581  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  73.46 
 
 
466 aa  566  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  68.81 
 
 
465 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  64.92 
 
 
461 aa  551  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  68.82 
 
 
484 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  61.37 
 
 
446 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  62.05 
 
 
429 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  63.41 
 
 
456 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  66.38 
 
 
490 aa  524  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  68.5 
 
 
478 aa  518  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  71.84 
 
 
473 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  64.1 
 
 
464 aa  511  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  65.66 
 
 
460 aa  507  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  63.62 
 
 
463 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  65.22 
 
 
463 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  63.96 
 
 
448 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  62.79 
 
 
445 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  62.79 
 
 
445 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  62.79 
 
 
445 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  64.3 
 
 
436 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  62.19 
 
 
494 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  61.3 
 
 
500 aa  497  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  62.89 
 
 
445 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  60.22 
 
 
519 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  64.32 
 
 
457 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  65.22 
 
 
456 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  61.54 
 
 
456 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  62.93 
 
 
441 aa  480  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  64.12 
 
 
465 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  61.14 
 
 
452 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  61.8 
 
 
448 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  60.26 
 
 
502 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  62.33 
 
 
436 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  60.18 
 
 
477 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  72.05 
 
 
499 aa  465  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  56.82 
 
 
459 aa  456  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  55.58 
 
 
462 aa  450  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 
447 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 
450 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  53.18 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  53.15 
 
 
441 aa  418  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  49.34 
 
 
440 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  48.51 
 
 
435 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 
441 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  51.52 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  49.88 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  48.17 
 
 
435 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.24 
 
 
441 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  48.79 
 
 
448 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  48.85 
 
 
434 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  51.26 
 
 
458 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 
434 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  47.7 
 
 
438 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  47.95 
 
 
432 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 
485 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  53.61 
 
 
447 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  47.71 
 
 
432 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 
444 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  53.76 
 
 
429 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.54 
 
 
443 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  47.69 
 
 
447 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  48.61 
 
 
453 aa  378  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  45.98 
 
 
439 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  49.89 
 
 
459 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  44.95 
 
 
441 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  48.85 
 
 
447 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  49.16 
 
 
422 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  46.39 
 
 
457 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  48.94 
 
 
423 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.39 
 
 
731 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  48.82 
 
 
443 aa  365  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  43.94 
 
 
440 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  49.54 
 
 
446 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  50.36 
 
 
435 aa  364  1e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.6 
 
 
431 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.79 
 
 
726 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  46.3 
 
 
444 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  48.51 
 
 
457 aa  362  9e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  45.58 
 
 
457 aa  361  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.54 
 
 
739 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  48.38 
 
 
446 aa  361  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  46.28 
 
 
457 aa  359  6e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  46.74 
 
 
447 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  43.29 
 
 
426 aa  358  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  47.24 
 
 
461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  48.26 
 
 
446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  40.92 
 
 
445 aa  354  1e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  47.15 
 
 
505 aa  353  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  47.58 
 
 
445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  46.33 
 
 
459 aa  352  7e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  51.82 
 
 
427 aa  351  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  46.56 
 
 
447 aa  352  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  48.18 
 
 
463 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  47.63 
 
 
449 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  46.53 
 
 
432 aa  351  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  44.49 
 
 
437 aa  350  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  45.41 
 
 
428 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  44.6 
 
 
426 aa  348  8e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>