More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_12760 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  100 
 
 
465 aa  921    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  69.34 
 
 
456 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  67.86 
 
 
474 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  64.69 
 
 
461 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  68.72 
 
 
466 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  63.42 
 
 
484 aa  529  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  63.33 
 
 
456 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  62.53 
 
 
446 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  62.55 
 
 
464 aa  511  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  63.33 
 
 
490 aa  510  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  63.53 
 
 
463 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  60.4 
 
 
429 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  65.74 
 
 
473 aa  498  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  63.71 
 
 
478 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  61.68 
 
 
494 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  61.25 
 
 
445 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  63.24 
 
 
448 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  61.25 
 
 
445 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  61.25 
 
 
445 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  61.3 
 
 
463 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  62.14 
 
 
445 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  61.16 
 
 
436 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  59.34 
 
 
519 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  60.6 
 
 
456 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  61.04 
 
 
460 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  57.97 
 
 
500 aa  484  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  58.49 
 
 
462 aa  481  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  62.39 
 
 
456 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  64.61 
 
 
457 aa  475  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  58.46 
 
 
502 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  62.04 
 
 
465 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  62.16 
 
 
441 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  56.99 
 
 
459 aa  472  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  60.82 
 
 
452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  59.01 
 
 
436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  59.4 
 
 
477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  59.95 
 
 
448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  63.29 
 
 
499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  50 
 
 
450 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.9 
 
 
441 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  49.57 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  50.33 
 
 
448 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 
435 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 
434 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 
434 aa  412  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 
444 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  47.91 
 
 
447 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  49.77 
 
 
432 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  48.33 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  46.99 
 
 
437 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  54.09 
 
 
447 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 
432 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
441 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  47.2 
 
 
447 aa  386  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  48.45 
 
 
435 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  52.36 
 
 
429 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  47.82 
 
 
438 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  50 
 
 
446 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  46.24 
 
 
443 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  50.59 
 
 
446 aa  382  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
446 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  48.04 
 
 
443 aa  376  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  48.04 
 
 
432 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.26 
 
 
485 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  49.43 
 
 
458 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  45.5 
 
 
439 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  43.6 
 
 
441 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 
436 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 
455 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 
436 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 
457 aa  366  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  47.6 
 
 
447 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  47.42 
 
 
436 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 
436 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 
447 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 
436 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 
436 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  47.42 
 
 
436 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  46.14 
 
 
426 aa  363  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  47.47 
 
 
432 aa  363  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  50 
 
 
437 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 
437 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 
453 aa  363  3e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  49.54 
 
 
437 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  48.63 
 
 
435 aa  362  8e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  45.91 
 
 
436 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  47.96 
 
 
449 aa  361  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  50.6 
 
 
423 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  45.91 
 
 
436 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  45.91 
 
 
436 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  45.45 
 
 
436 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  44.47 
 
 
445 aa  360  3e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  45.2 
 
 
444 aa  359  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  45.08 
 
 
437 aa  359  7e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  44.57 
 
 
416 aa  359  7e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  48.26 
 
 
505 aa  358  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  46.58 
 
 
459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  45.73 
 
 
454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  44.71 
 
 
425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>