More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0211 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 393 aa  803    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0066  AAA ATPase central domain protein  58.46 
 
 		 396 aa  477  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1825  recombination factor protein RarA  53.3 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1569  recombination factor protein RarA  54.41 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  52.33 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0191  recombination factor protein RarA  53.35 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0229  recombination factor protein RarA  53.61 
 
 		 393 aa  395  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1776  recombination factor protein RarA  50.25 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0208  recombination factor protein RarA  53.35 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  44.02 
 
 		 426 aa  288  9e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  39.42 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  37.59 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  41.82 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  39.38 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  39.38 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  39.7 
 
 		 432 aa  283  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  40.56 
 
 		 441 aa  282  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 		 408 aa  282  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  40.19 
 
 		 446 aa  282  7.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  42.28 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  38.94 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  39.13 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  38.98 
 
 		 456 aa  279  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  38.8 
 
 		 428 aa  279  7e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  36.56 
 
 		 416 aa  278  9e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  38.35 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  40.89 
 
 		 395 aa  276  3e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  37.59 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  40.93 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  41.32 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0154  recombination factor protein RarA  37.75 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  36.87 
 
 		 446 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  40.61 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  38.52 
 
 		 432 aa  272  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  38.85 
 
 		 425 aa  272  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  40.46 
 
 		 428 aa  273  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  39.95 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  37.68 
 
 		 431 aa  272  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  39.95 
 
 		 435 aa  272  9e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  40.46 
 
 		 428 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  40.71 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  40.71 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  40.71 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  39.69 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  40.68 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  40.2 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  39.81 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  40.46 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  40.46 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  40.46 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  35.78 
 
 		 429 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  37.62 
 
 		 435 aa  269  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  41.93 
 
 		 439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  40.2 
 
 		 428 aa  269  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  39.95 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  37.96 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  36.99 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  41.38 
 
 		 436 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.16 
 
 		 599 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.41 
 
 		 599 aa  266  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  39.8 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  38.83 
 
 		 435 aa  265  8.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  38.04 
 
 		 463 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  37.4 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.75 
 
 		 731 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  37.37 
 
 		 456 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  37.71 
 
 		 453 aa  263  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  36.73 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  37.71 
 
 		 457 aa  263  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  39.71 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  40.31 
 
 		 434 aa  262  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  36.71 
 
 		 445 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  38.69 
 
 		 419 aa  262  8e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  36.71 
 
 		 445 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  36.71 
 
 		 445 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  36.98 
 
 		 447 aa  262  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  39.69 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1853  recombination factor protein RarA  37.59 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  37.78 
 
 		 427 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  39.2 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  39.18 
 
 		 424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  39.18 
 
 		 424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.08 
 
 		 739 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1704  ATPase central domain-containing protein  38.69 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  37.17 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  39.1 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  38.74 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  39.13 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  38.6 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  38.44 
 
 		 441 aa  256  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  38.01 
 
 		 440 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  36.91 
 
 		 438 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  36.5 
 
 		 439 aa  255  8e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  38.38 
 
 		 463 aa  255  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  35.34 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  36.36 
 
 		 461 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  34.8 
 
 		 440 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  37.47 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  36.76 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  40.62 
 
 		 436 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>