More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1704 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1704  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 448 aa  907    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  49.28 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.27 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  51.11 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  48.78 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.24 
 
 		 731 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  50.37 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 		 447 aa  378  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.29 
 
 		 739 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  46.31 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  44.37 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  46.81 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  45.21 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  45.86 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  47.94 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  46.9 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  45.69 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  48.87 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  48.87 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  48.64 
 
 		 445 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  46.4 
 
 		 440 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 		 485 aa  361  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  45.41 
 
 		 447 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  46.7 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  46.88 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  47.33 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  48.89 
 
 		 422 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.27 
 
 		 431 aa  356  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  49.74 
 
 		 447 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.53 
 
 		 726 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  47.58 
 
 		 435 aa  352  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  44.11 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  45.22 
 
 		 444 aa  349  6e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  46.14 
 
 		 441 aa  349  7e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  45.81 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  43.58 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  43.19 
 
 		 457 aa  346  6e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  42.95 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  45.48 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  46.59 
 
 		 505 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 		 451 aa  342  5.999999999999999e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  42.73 
 
 		 437 aa  342  8e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  46.49 
 
 		 433 aa  342  8e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  42.35 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  44.29 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  49.18 
 
 		 500 aa  338  8e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.73 
 
 		 721 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  43.47 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.91 
 
 		 735 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  42.73 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  44.52 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.03 
 
 		 733 aa  337  3.9999999999999995e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.14 
 
 		 734 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  42.99 
 
 		 443 aa  335  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.14 
 
 		 734 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  42.29 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  44.34 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  43.5 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  42.52 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  44.52 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  45.07 
 
 		 445 aa  333  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  47.78 
 
 		 448 aa  333  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  44.18 
 
 		 447 aa  333  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  44.62 
 
 		 447 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  43.91 
 
 		 438 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  43.95 
 
 		 443 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  44.62 
 
 		 481 aa  332  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 443 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  43.78 
 
 		 444 aa  332  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  43.09 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  43.09 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  42.93 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  42.56 
 
 		 447 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  43.54 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  41.51 
 
 		 445 aa  331  1e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  45.3 
 
 		 423 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  42.52 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  41.84 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  42.18 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  43.19 
 
 		 447 aa  329  7e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 453 aa  329  8e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  46.28 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  42.28 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  42.28 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  44.93 
 
 		 455 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  42.02 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  43.23 
 
 		 447 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  42.28 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  42.63 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  43.08 
 
 		 440 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  43.95 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  43.08 
 
 		 437 aa  326  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  44.94 
 
 		 437 aa  325  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>