More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1668 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  100 
 
 		 320 aa  648    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  90.94 
 
 		 319 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  89.27 
 
 		 322 aa  590  1e-168  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  88.92 
 
 		 324 aa  587  1e-166  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  66.35 
 
 		 329 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  66.22 
 
 		 329 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  64.58 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  64.74 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  60.25 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  57.1 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  54.6 
 
 		 348 aa  338  5e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  50.96 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  51.59 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  47.56 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  48.7 
 
 		 317 aa  296  2e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  47.56 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  47.56 
 
 		 315 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  47.56 
 
 		 315 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  43.23 
 
 		 322 aa  278  6e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  44.12 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  45.17 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  46.53 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  45.1 
 
 		 322 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  42.35 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  44.37 
 
 		 321 aa  265  8e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  42.35 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  43.88 
 
 		 326 aa  262  6.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  43.73 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  43.55 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  42.21 
 
 		 326 aa  245  9e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  43.38 
 
 		 342 aa  242  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  39.48 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  42.01 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  42.31 
 
 		 316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  47.3 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  39.3 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  38.49 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  40 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  39.05 
 
 		 350 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  36.28 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  41.46 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  36.39 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  37.04 
 
 		 369 aa  207  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  44.53 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  35.29 
 
 		 398 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  39.31 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  57.25 
 
 		 940 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  33.63 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  33.45 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  32.67 
 
 		 341 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  31.15 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  29.43 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  33.33 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  31.23 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  28.7 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  33.89 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  32.81 
 
 		 363 aa  125  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  35.78 
 
 		 483 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.59 
 
 		 517 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  34.91 
 
 		 451 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  33.64 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.53 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  30.77 
 
 		 548 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.73 
 
 		 518 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.87 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  33.93 
 
 		 497 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.15 
 
 		 478 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  33.01 
 
 		 481 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  36.62 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  25.07 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  34.88 
 
 		 642 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  32.44 
 
 		 497 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  31.06 
 
 		 582 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  31.38 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  31.68 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  32.39 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.78 
 
 		 554 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  34.53 
 
 		 443 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  28.63 
 
 		 575 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.36 
 
 		 755 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  31.14 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.54 
 
 		 589 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  28.62 
 
 		 568 aa  103  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  34.47 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  31.93 
 
 		 807 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.99 
 
 		 582 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.21 
 
 		 602 aa  102  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.05 
 
 		 550 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  29.64 
 
 		 579 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.99 
 
 		 579 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  31.96 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  32.42 
 
 		 507 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.65 
 
 		 529 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  28.04 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.18 
 
 		 427 aa  99.8  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.94 
 
 		 627 aa  99.8  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  29.05 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.68 
 
 		 527 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  33.47 
 
 		 423 aa  99.4  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.84 
 
 		 550 aa  98.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>