More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2519 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  100 
 
 		 349 aa  698    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  66.36 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  66.67 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  59.64 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  62.02 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  33.14 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  32.55 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  33.11 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  32.24 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  29.29 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  28.99 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  31.25 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  29.29 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  28.99 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  32.88 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  31.76 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  29.77 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  28.62 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  32.22 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  30.49 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  29.29 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  28.66 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  29.59 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  28.87 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  31.21 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  28.67 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  30.85 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  29.82 
 
 		 327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  30.51 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  30.3 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  28.9 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  27.69 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  28.57 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  28.74 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  29.26 
 
 		 342 aa  106  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  29.66 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  25.68 
 
 		 347 aa  103  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  26.94 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  27.03 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  26.87 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  27.01 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  28.24 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  29.31 
 
 		 322 aa  95.9  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  26.43 
 
 		 369 aa  95.9  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  29.31 
 
 		 289 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  27.93 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  27.24 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  26.11 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  27.53 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  24.79 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  26.98 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  27.61 
 
 		 356 aa  86.3  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.44 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  27.08 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  25.85 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  28.98 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  25.26 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.42 
 
 		 690 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  25.3 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1085  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.22 
 
 		 714 aa  79.7  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.72 
 
 		 939 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.81 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  24.91 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.72 
 
 		 911 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.42 
 
 		 685 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2112  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.24 
 
 		 730 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635796  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.05 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  32.09 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.97 
 
 		 553 aa  76.6  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.04 
 
 		 921 aa  77  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.66 
 
 		 1040 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  23.79 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  26.64 
 
 		 575 aa  76.3  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.89 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.89 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1191  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.61 
 
 		 728 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.775033  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.89 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3198  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.16 
 
 		 658 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.344651  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.48 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.26 
 
 		 1115 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.89 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.89 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.89 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.89 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.51 
 
 		 1045 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  28.89 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  27.97 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.72 
 
 		 1147 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.72 
 
 		 1137 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.89 
 
 		 642 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2534  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.97 
 
 		 752 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.821414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.72 
 
 		 1137 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.71 
 
 		 795 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.56 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.51 
 
 		 1071 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.23 
 
 		 642 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.89 
 
 		 643 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.22 
 
 		 642 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.89 
 
 		 642 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>