More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119614 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  100 
 
 		 332 aa  690    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  45.25 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  45.19 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  43.17 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  42.4 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  41.41 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  40 
 
 		 329 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  40.58 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  40.98 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  40.79 
 
 		 326 aa  235  9e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  38.06 
 
 		 317 aa  233  5e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  36.27 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  47.3 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  40.88 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  40.94 
 
 		 322 aa  229  6e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  37.82 
 
 		 348 aa  229  7e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  37.22 
 
 		 322 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  46.47 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  35.62 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  34.97 
 
 		 315 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  35.62 
 
 		 315 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  40.27 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  45.23 
 
 		 326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  39.94 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  35.29 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  44.35 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  34.67 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  45.42 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  33.66 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  45.23 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  35.18 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  34.42 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  34.2 
 
 		 322 aa  206  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  33.12 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  44.34 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  40.49 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  33.77 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  34.47 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  33.1 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  39.29 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  40.26 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  39.77 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  40.82 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  46.83 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  35.82 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  42.34 
 
 		 325 aa  176  7e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  50 
 
 		 940 aa  149  5e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  30.68 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  31.82 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  32.92 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  30.84 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  31.39 
 
 		 331 aa  122  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  29.17 
 
 		 356 aa  119  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  29.34 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  29.76 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  30.96 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  31.73 
 
 		 669 aa  110  3e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  32.05 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  32.13 
 
 		 363 aa  105  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  28.46 
 
 		 650 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  27.65 
 
 		 568 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  28.51 
 
 		 481 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.92 
 
 		 527 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  29.8 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  31.13 
 
 		 642 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  29.39 
 
 		 483 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.44 
 
 		 580 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.69 
 
 		 605 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00653224  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.54 
 
 		 540 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  31.36 
 
 		 497 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.62 
 
 		 562 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.78 
 
 		 546 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.62 
 
 		 562 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.62 
 
 		 562 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  26.91 
 
 		 578 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.57 
 
 		 550 aa  99.8  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  31.11 
 
 		 514 aa  99.4  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  26.59 
 
 		 579 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.66 
 
 		 579 aa  99.4  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.66 
 
 		 582 aa  99.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  25.61 
 
 		 584 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.46 
 
 		 732 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  29.36 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  25 
 
 		 526 aa  99  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.2 
 
 		 562 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.18 
 
 		 579 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.46 
 
 		 595 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  26.59 
 
 		 586 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  28.41 
 
 		 602 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.41 
 
 		 569 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  27.73 
 
 		 652 aa  97.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.94 
 
 		 663 aa  97.4  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.69 
 
 		 602 aa  97.1  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0330154  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.2 
 
 		 562 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.2 
 
 		 562 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.2 
 
 		 562 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.2 
 
 		 562 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.69 
 
 		 602 aa  97.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.22 
 
 		 565 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.22 
 
 		 565 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>