More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1412 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  100 
 
 		 315 aa  645    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  90.79 
 
 		 315 aa  599  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  90.48 
 
 		 315 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  90.16 
 
 		 315 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  57.93 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  55.41 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  56.59 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  54.06 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  51.46 
 
 		 341 aa  362  5.0000000000000005e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  51.46 
 
 		 330 aa  359  3e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  53.57 
 
 		 321 aa  359  4e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  53.35 
 
 		 325 aa  359  4e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  51.14 
 
 		 322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  52.88 
 
 		 326 aa  355  5e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  51.66 
 
 		 326 aa  355  7.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  51.14 
 
 		 323 aa  354  8.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  49.36 
 
 		 322 aa  354  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  50.81 
 
 		 322 aa  351  8e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  51.67 
 
 		 327 aa  348  7e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  51.31 
 
 		 326 aa  341  7e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  50 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  48.38 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  49.68 
 
 		 328 aa  308  5e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  48.99 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  47.56 
 
 		 320 aa  297  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  46.33 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  46.91 
 
 		 324 aa  295  8e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  45.93 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  46.58 
 
 		 319 aa  285  5e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  73.89 
 
 		 940 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  44.84 
 
 		 347 aa  272  6e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  44.73 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  40.2 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  46.33 
 
 		 316 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  41.03 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  38.46 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  43.22 
 
 		 342 aa  246  4e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  40.13 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  37.5 
 
 		 398 aa  236  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  45.42 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  41.31 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  34.97 
 
 		 332 aa  225  9e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  37.54 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  38.18 
 
 		 387 aa  221  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  46.85 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  36.28 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  35.91 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  32.84 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  32.93 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  31.45 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  31.1 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  31.16 
 
 		 332 aa  165  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  30.29 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  35.96 
 
 		 356 aa  139  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  28.19 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  27.7 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  31.37 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  30.23 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  30.62 
 
 		 600 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  27.14 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.3 
 
 		 632 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.62 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  26.91 
 
 		 355 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  35.14 
 
 		 595 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.63 
 
 		 602 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  33.78 
 
 		 579 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  28.31 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.65 
 
 		 732 aa  113  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  29.28 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.53 
 
 		 462 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  33.33 
 
 		 584 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.36 
 
 		 634 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.89 
 
 		 586 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  30.26 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  32.84 
 
 		 575 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.96 
 
 		 540 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  31.6 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  33.95 
 
 		 669 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.39 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.82 
 
 		 569 aa  109  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1410  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.76 
 
 		 594 aa  109  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  28.57 
 
 		 526 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.14 
 
 		 361 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  31.93 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.87 
 
 		 518 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.49 
 
 		 621 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.94 
 
 		 478 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.94 
 
 		 478 aa  106  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.3 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.84 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.36 
 
 		 602 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  31.02 
 
 		 629 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.14 
 
 		 568 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.68 
 
 		 589 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.58 
 
 		 520 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.05 
 
 		 664 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32 
 
 		 627 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.62 
 
 		 588 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.49 
 
 		 578 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  30.13 
 
 		 650 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>