More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2050 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  100 
 
 		 326 aa  667    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  80.43 
 
 		 330 aa  549  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  60.75 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  55.66 
 
 		 317 aa  364  1e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  52.88 
 
 		 315 aa  355  5e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  53.53 
 
 		 315 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  54.17 
 
 		 315 aa  351  8e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  54.17 
 
 		 315 aa  351  1e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  51.86 
 
 		 348 aa  342  5e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  50.64 
 
 		 322 aa  332  5e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  50 
 
 		 329 aa  328  6e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  51.27 
 
 		 322 aa  326  3e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  50.96 
 
 		 320 aa  326  3e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  51.27 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  50 
 
 		 319 aa  317  1e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  49.69 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  45.89 
 
 		 323 aa  315  8e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  49.69 
 
 		 326 aa  312  4.999999999999999e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  50 
 
 		 326 aa  311  9e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  47.19 
 
 		 322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  49.38 
 
 		 329 aa  309  4e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  47.62 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  48.33 
 
 		 305 aa  309  4e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  48.08 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  48.51 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  47.77 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  46.15 
 
 		 334 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  50.96 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  47.06 
 
 		 322 aa  295  9e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  46.33 
 
 		 326 aa  292  6e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  45.98 
 
 		 316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  46.2 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  44.94 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  42.35 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  44.44 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  43.28 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  42.27 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  47.97 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  38.51 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  35.78 
 
 		 398 aa  230  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  38.62 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  38.14 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  37.79 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  45.23 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  39.24 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  36.76 
 
 		 387 aa  214  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  58.65 
 
 		 940 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  32.73 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  31.81 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  29.12 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  31.38 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  29.41 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  29.88 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  28.65 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  31.67 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  31.96 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  28.69 
 
 		 356 aa  132  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.73 
 
 		 529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  27.54 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  31.69 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  28.69 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  29.21 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  34.01 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  32.77 
 
 		 363 aa  123  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.48 
 
 		 546 aa  119  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1410  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  32.74 
 
 		 594 aa  117  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  33.78 
 
 		 575 aa  116  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  30.65 
 
 		 602 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.43 
 
 		 553 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  28.24 
 
 		 526 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.6 
 
 		 554 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.22 
 
 		 467 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  34.02 
 
 		 418 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  32.94 
 
 		 454 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.89 
 
 		 478 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.33 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.41 
 
 		 517 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  34.43 
 
 		 483 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.39 
 
 		 554 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.5 
 
 		 478 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.76 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  34.45 
 
 		 467 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  34.13 
 
 		 451 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  30.64 
 
 		 807 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.81 
 
 		 627 aa  103  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30 
 
 		 589 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.56 
 
 		 501 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  24.23 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.26 
 
 		 562 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.5 
 
 		 588 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.9 
 
 		 562 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.96 
 
 		 562 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.96 
 
 		 562 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0470  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.74 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.96 
 
 		 562 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.96 
 
 		 562 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.96 
 
 		 562 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.2 
 
 		 543 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.24 
 
 		 527 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.44 
 
 		 562 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>