More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04440 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  100 
 
 		 356 aa  743    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  61.69 
 
 		 352 aa  461  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  50.85 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  50.7 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  40.51 
 
 		 355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  32.65 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  29.23 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  31.3 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  31.23 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  29.31 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  39.11 
 
 		 328 aa  143  6e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  30.29 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  38.67 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  38.22 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  34.02 
 
 		 326 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  33.89 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  35.96 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  31.25 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  31.32 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  37.72 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  33.91 
 
 		 327 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  36.09 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  29.75 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  28.86 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  29.34 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  32.79 
 
 		 369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  28.69 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  34.48 
 
 		 338 aa  133  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  29.31 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  33.19 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  27.17 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  34.65 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  32.61 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  35.09 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  35.09 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  28.48 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  30.99 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  31.74 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  33.33 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  28.45 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  31.65 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  31.1 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  33.48 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  35.87 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  35.27 
 
 		 325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  36.06 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  32.92 
 
 		 289 aa  119  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  29.17 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  33.62 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  32.31 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  34.21 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  27.46 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  27.17 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  31.2 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  30.83 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  36.69 
 
 		 940 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  30.17 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  27.52 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  30.49 
 
 		 332 aa  99.4  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  27.89 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  23.94 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  27.76 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  25 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.83 
 
 		 627 aa  71.2  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.2 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.2 
 
 		 606 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.2 
 
 		 601 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  23.88 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.84 
 
 		 452 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.30319 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.68 
 
 		 1147 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.68 
 
 		 1137 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  25.54 
 
 		 807 aa  64.7  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.32 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.81 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.46 
 
 		 1115 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.46 
 
 		 1137 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  23.5 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.76 
 
 		 682 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.23 
 
 		 957 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.6 
 
 		 948 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  24.58 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  24.58 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.79 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.56 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.46 
 
 		 939 aa  59.7  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  23.29 
 
 		 429 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.52 
 
 		 550 aa  59.3  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.19 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0492  putative DNA polymerase III, gamma/tau subunit  24.62 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.77 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.45 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.87 
 
 		 1113 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  25.74 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  23.75 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.66 
 
 		 650 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.4 
 
 		 921 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.28 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.98 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.23 
 
 		 678 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>