More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0492 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0492  putative DNA polymerase III, gamma/tau subunit  100 
 
 
396 aa  803    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.9 
 
 
614 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.54 
 
 
582 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.95 
 
 
505 aa  280  4e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.547641  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0166  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.68 
 
 
608 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1060  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  40.49 
 
 
533 aa  274  2.0000000000000002e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077321  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.02 
 
 
580 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0710  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.02 
 
 
582 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3876  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.14 
 
 
584 aa  273  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0650  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.3 
 
 
587 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0107119  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0942  DNA-directed DNA polymerase  38.13 
 
 
491 aa  269  7e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3649  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.56 
 
 
592 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.89772  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.32 
 
 
687 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.89 
 
 
565 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4848  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.17 
 
 
618 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4336  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.37 
 
 
659 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.24 
 
 
582 aa  259  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.21 
 
 
478 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.21 
 
 
478 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4057  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.32 
 
 
600 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.495634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4575  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.73 
 
 
632 aa  256  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0369  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.7 
 
 
611 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.797615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1861  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.34 
 
 
628 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.33363  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2196  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.34 
 
 
626 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.12 
 
 
634 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0619  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.21 
 
 
623 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0462  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.52 
 
 
615 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3142  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.24 
 
 
637 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0668  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.92 
 
 
627 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.68 
 
 
624 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.818033  normal  0.0455941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.04 
 
 
681 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1812  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.81 
 
 
623 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181409  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0435  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.28 
 
 
606 aa  250  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.853663  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.67 
 
 
534 aa  249  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.86 
 
 
606 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4397  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.56 
 
 
625 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0274  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.69 
 
 
628 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4752  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.45 
 
 
605 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.04 
 
 
698 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.74 
 
 
602 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.47 
 
 
605 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00653224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2168  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.55 
 
 
622 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531905  normal  0.517298 
 
 
-
 
NC_004310  BR0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.74 
 
 
602 aa  245  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0330154  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4077  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.02 
 
 
626 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0110  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.51 
 
 
631 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801093  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.26 
 
 
565 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.26 
 
 
565 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.71 
 
 
605 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0256  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.08 
 
 
651 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0966021  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.89 
 
 
543 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.920332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.98 
 
 
601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.98 
 
 
601 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7346  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.09 
 
 
613 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1217  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.89 
 
 
601 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.28 
 
 
570 aa  243  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3432  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.54 
 
 
625 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  43.3 
 
 
650 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0255  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.96 
 
 
623 aa  240  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  42.96 
 
 
652 aa  239  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  42.96 
 
 
605 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.5 
 
 
517 aa  239  5.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.27 
 
 
606 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  40.95 
 
 
565 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  39.21 
 
 
529 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1357  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.53 
 
 
573 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0803491  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  44.17 
 
 
586 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  40.63 
 
 
565 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  44.17 
 
 
584 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.61 
 
 
695 aa  236  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.27 
 
 
663 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.68 
 
 
518 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.1 
 
 
914 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  37.92 
 
 
602 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.1 
 
 
736 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.57 
 
 
447 aa  234  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.46 
 
 
599 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.52 
 
 
467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  38.87 
 
 
568 aa  233  5e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.38 
 
 
501 aa  233  6e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.32 
 
 
560 aa  231  1e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.21 
 
 
602 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.07 
 
 
460 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.37 
 
 
518 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.46 
 
 
421 aa  230  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.46 
 
 
554 aa  230  4e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  40.89 
 
 
537 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.22 
 
 
527 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.58 
 
 
737 aa  229  9e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  38.77 
 
 
580 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.11 
 
 
579 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.1 
 
 
553 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.69 
 
 
546 aa  228  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.34 
 
 
735 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.96 
 
 
586 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.61 
 
 
587 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  43.11 
 
 
579 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.24 
 
 
550 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.1 
 
 
551 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0511  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.2 
 
 
614 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.16 
 
 
569 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>