More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1248 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  100 
 
 		 322 aa  654    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  77.64 
 
 		 322 aa  507  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  72.78 
 
 		 323 aa  479  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  74.04 
 
 		 326 aa  471  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  69.62 
 
 		 321 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  55.41 
 
 		 330 aa  362  5.0000000000000005e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  55.41 
 
 		 317 aa  360  1e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  55.41 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  52.44 
 
 		 315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  51.14 
 
 		 315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  52.12 
 
 		 315 aa  355  5e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  51.47 
 
 		 315 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  54.66 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  54.78 
 
 		 322 aa  353  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  56.76 
 
 		 305 aa  351  8e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  54.93 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  55.48 
 
 		 327 aa  336  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  47.19 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  47.17 
 
 		 325 aa  305  7e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  47.08 
 
 		 329 aa  302  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  46.06 
 
 		 330 aa  299  3e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  45.91 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  48.05 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  46.62 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  47.32 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  45.75 
 
 		 324 aa  276  2e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  46.1 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  44.95 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  45.1 
 
 		 320 aa  271  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  44.63 
 
 		 319 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  43.95 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  39.42 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  42.06 
 
 		 342 aa  242  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  39.81 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  38.91 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  39.68 
 
 		 347 aa  232  5e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  40.78 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  40.32 
 
 		 325 aa  225  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  44 
 
 		 289 aa  220  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  36.36 
 
 		 322 aa  212  7e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  37.54 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  35.18 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  36.09 
 
 		 363 aa  206  6e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  36.67 
 
 		 350 aa  203  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  35 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  60.9 
 
 		 940 aa  195  9e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  35.42 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  34.32 
 
 		 398 aa  189  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  34.34 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  31.04 
 
 		 341 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  30.93 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  33.73 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  29.31 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  34.21 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  28.4 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  28.85 
 
 		 355 aa  122  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  27.58 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  26.72 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  31.14 
 
 		 483 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  27.97 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 518 aa  109  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  35.32 
 
 		 575 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.08 
 
 		 606 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.62 
 
 		 517 aa  105  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.95 
 
 		 602 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.64 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2534  DNA-directed DNA polymerase  30.18 
 
 		 614 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.505064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.1 
 
 		 732 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  27.18 
 
 		 526 aa  103  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.02 
 
 		 589 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.67 
 
 		 606 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.67 
 
 		 601 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.67 
 
 		 601 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  32.37 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1670  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.22 
 
 		 605 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.595012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  30.73 
 
 		 582 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.32 
 
 		 467 aa  99.8  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.71 
 
 		 529 aa  99.4  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  31.19 
 
 		 481 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.84 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  27.65 
 
 		 451 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.6 
 
 		 569 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  26.19 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.77 
 
 		 664 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.91 
 
 		 649 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  31.67 
 
 		 497 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.76 
 
 		 567 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  34.58 
 
 		 499 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.8 
 
 		 569 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1399  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.73 
 
 		 716 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl678  DNA polymerase III gamma and tau subunits  28.63 
 
 		 631 aa  96.3  6e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.94 
 
 		 496 aa  96.3  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4903  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.78 
 
 		 731 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.86 
 
 		 527 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  30.52 
 
 		 454 aa  95.9  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.4 
 
 		 395 aa  95.9  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  30.65 
 
 		 600 aa  95.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  29.31 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.63 
 
 		 518 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.22 
 
 		 678 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>