More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1312 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  100 
 
 		 940 aa  1910    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  75.56 
 
 		 315 aa  290  8e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  74.44 
 
 		 315 aa  287  7e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  73.33 
 
 		 315 aa  284  7.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  73.89 
 
 		 315 aa  283  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  65.69 
 
 		 334 aa  207  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  63.91 
 
 		 321 aa  202  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  63.91 
 
 		 322 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  63.5 
 
 		 317 aa  199  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  61.76 
 
 		 322 aa  196  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  61.94 
 
 		 325 aa  195  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  60.9 
 
 		 322 aa  195  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  62.5 
 
 		 326 aa  194  5e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  61.65 
 
 		 323 aa  193  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  61.65 
 
 		 330 aa  190  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  62.41 
 
 		 330 aa  189  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  61.65 
 
 		 326 aa  188  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  60.9 
 
 		 341 aa  188  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  58.96 
 
 		 327 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  51.79 
 
 		 305 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  58.65 
 
 		 326 aa  182  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  57.25 
 
 		 320 aa  178  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  58.02 
 
 		 324 aa  177  7e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  57.25 
 
 		 322 aa  177  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  57.25 
 
 		 329 aa  177  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  57.25 
 
 		 329 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  58.02 
 
 		 326 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  57.25 
 
 		 348 aa  174  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  57.25 
 
 		 319 aa  171  7e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  57.25 
 
 		 328 aa  169  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  56.15 
 
 		 318 aa  168  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  54.36 
 
 		 387 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  53.1 
 
 		 369 aa  160  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  46.43 
 
 		 347 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  47.9 
 
 		 289 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  50.68 
 
 		 363 aa  157  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  47.06 
 
 		 349 aa  157  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  55.3 
 
 		 316 aa  156  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  47.12 
 
 		 325 aa  156  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  44.38 
 
 		 334 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  50.7 
 
 		 342 aa  153  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  51.47 
 
 		 322 aa  151  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  48.51 
 
 		 373 aa  151  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  50 
 
 		 332 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  49.64 
 
 		 338 aa  149  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  50 
 
 		 398 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  50.34 
 
 		 350 aa  147  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  32.63 
 
 		 963 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  35.64 
 
 		 340 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  36.42 
 
 		 331 aa  121  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  34.43 
 
 		 336 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  35.43 
 
 		 332 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  28.94 
 
 		 661 aa  111  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  30.81 
 
 		 331 aa  106  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  33.52 
 
 		 341 aa  105  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  36.69 
 
 		 356 aa  104  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  34.57 
 
 		 361 aa  93.6  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  36.53 
 
 		 355 aa  89.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  32.68 
 
 		 332 aa  89  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  33.33 
 
 		 363 aa  88.2  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  34.59 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  31.49 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  29.38 
 
 		 334 aa  83.2  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  40 
 
 		 484 aa  79.7  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  42.24 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  40 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.48 
 
 		 589 aa  78.6  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  38.26 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  30 
 
 		 575 aa  76.3  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  22.14 
 
 		 988 aa  75.5  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  34.43 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1410  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  33.77 
 
 		 594 aa  74.7  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 732 aa  73.9  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  34 
 
 		 526 aa  73.6  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34 
 
 		 467 aa  73.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.15 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.87 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.54 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  37.39 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.87 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  28.49 
 
 		 334 aa  72  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.23 
 
 		 595 aa  71.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.25 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.5 
 
 		 501 aa  70.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  34.96 
 
 		 476 aa  70.5  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  30.86 
 
 		 600 aa  70.5  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.48 
 
 		 518 aa  70.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  34.48 
 
 		 514 aa  70.1  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  30.12 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.9 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.54 
 
 		 546 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.13 
 
 		 650 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.11 
 
 		 632 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.13 
 
 		 648 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.92 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.99 
 
 		 634 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  30.23 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.49 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  33.62 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  28.9 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>