40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0322 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  100 
 
 		 661 aa  1337    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  33.95 
 
 		 963 aa  196  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  29.68 
 
 		 988 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2096  30S ribosomal protein S12P  83.12 
 
 		 147 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1968  30S ribosomal protein S12P  81.82 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000106893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0698  30S ribosomal protein S12P  84.21 
 
 		 147 aa  127  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00910489  normal  0.0527609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2326  30S ribosomal protein S12P  82.89 
 
 		 147 aa  127  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000138324  hitchhiker  0.00000152235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0281  30S ribosomal protein S12P  79.22 
 
 		 147 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1199  ribosomal protein S23 (S12)  72.73 
 
 		 147 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0038  30S ribosomal protein S12P  72.73 
 
 		 146 aa  115  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000314149  normal  0.098925 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  28.94 
 
 		 940 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0070  ribosomal protein S23 (S12)  64.47 
 
 		 142 aa  107  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000707157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0033  30S ribosomal protein S12P  63.16 
 
 		 140 aa  106  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0354  30S ribosomal protein S12P  64.47 
 
 		 145 aa  104  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2157  ribosomal protein S23 (S12)  64.47 
 
 		 142 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1173  30S ribosomal protein S12P  61.84 
 
 		 142 aa  103  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000030185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0358  ribosomal protein S23 (S12)  64.47 
 
 		 142 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3688  30S ribosomal protein S12P  61.84 
 
 		 142 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2207  30S ribosomal protein S12P  64.47 
 
 		 142 aa  100  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.513202  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0101  30S ribosomal protein S12P  63.16 
 
 		 142 aa  100  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.322935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2383  30S ribosomal protein S12P  63.16 
 
 		 142 aa  98.2  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0510  30S ribosomal protein S12P  61.84 
 
 		 142 aa  98.6  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2830  30S ribosomal protein S12P  61.84 
 
 		 142 aa  97.4  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0281  30S ribosomal protein S12P  59.21 
 
 		 142 aa  96.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0382587  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0265  30S ribosomal protein S12P  60.53 
 
 		 142 aa  96.3  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1615  30S ribosomal protein S12P  59.21 
 
 		 142 aa  94.4  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729844 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0785  30S ribosomal protein S12P  56.16 
 
 		 147 aa  92.4  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1306  30S ribosomal protein S12P  56.25 
 
 		 147 aa  92.8  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0677  30S ribosomal protein S12P  56.25 
 
 		 147 aa  91.3  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0612  30S ribosomal protein S12P  56.16 
 
 		 147 aa  91.3  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0211  30S ribosomal protein S12P  56.16 
 
 		 147 aa  91.3  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87868  predicted protein  63.51 
 
 		 145 aa  90.9  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01345  40S ribosomal protein S23 (Broad)  62.16 
 
 		 145 aa  89  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32119  Ribosomal protein S23, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  62.16 
 
 		 142 aa  88.6  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0872909  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04360  40s ribosomal protein s23, putative  63.51 
 
 		 145 aa  87.8  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203835  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50701  predicted protein  63.51 
 
 		 143 aa  87.4  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  22.66 
 
 		 879 aa  51.2  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  22.34 
 
 		 1607 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 1381 aa  45.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  30.77 
 
 		 610 aa  44.3  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>