More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2096 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2096  30S ribosomal protein S12P  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1968  30S ribosomal protein S12P  95.24 
 
 		 147 aa  284  2.9999999999999996e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000106893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0698  30S ribosomal protein S12P  92.52 
 
 		 147 aa  263  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00910489  normal  0.0527609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2326  30S ribosomal protein S12P  91.84 
 
 		 147 aa  261  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000138324  hitchhiker  0.00000152235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0281  30S ribosomal protein S12P  72.11 
 
 		 147 aa  219  9e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0038  30S ribosomal protein S12P  67.83 
 
 		 146 aa  205  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000314149  normal  0.098925 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1199  ribosomal protein S23 (S12)  68.03 
 
 		 147 aa  203  5e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0070  ribosomal protein S23 (S12)  65.47 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000707157  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0354  30S ribosomal protein S12P  63.89 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2157  ribosomal protein S23 (S12)  62.59 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0281  30S ribosomal protein S12P  63.31 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0382587  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0510  30S ribosomal protein S12P  61.15 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0101  30S ribosomal protein S12P  61.87 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.322935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0358  ribosomal protein S23 (S12)  61.87 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1173  30S ribosomal protein S12P  60.28 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000030185  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2383  30S ribosomal protein S12P  61.15 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0033  30S ribosomal protein S12P  62.14 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3688  30S ribosomal protein S12P  60.43 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2207  30S ribosomal protein S12P  64.03 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.513202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1306  30S ribosomal protein S12P  59.18 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0265  30S ribosomal protein S12P  62.59 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0785  30S ribosomal protein S12P  57.82 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0211  30S ribosomal protein S12P  58.5 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0612  30S ribosomal protein S12P  58.5 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0677  30S ribosomal protein S12P  58.5 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01345  40S ribosomal protein S23 (Broad)  61.54 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2830  30S ribosomal protein S12P  60.43 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87868  predicted protein  58.74 
 
 		 145 aa  167  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1615  30S ribosomal protein S12P  60.43 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729844 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04360  40s ribosomal protein s23, putative  60.14 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203835  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50701  predicted protein  58.27 
 
 		 143 aa  163  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32119  Ribosomal protein S23, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  56.93 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0872909  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  83.12 
 
 		 661 aa  130  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86106  conserved hypothetical protein  37.25 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377423  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  39.18 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  40 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  37.65 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  36.67 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  39.29 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  38.2 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  35.58 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  32.76 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  32.67 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  34.44 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  37.78 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  36.9 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  37.78 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  37.78 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  37.78 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  36.9 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  35.56 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  37.65 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01910  ribosomal protein S12, putative  37.23 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.185549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  34.02 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  35.16 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  36.47 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  37.35 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  36.67 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  36.47 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  32.99 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  38.82 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0127  30S ribosomal protein S12  28.32 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  37.78 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  34.44 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0230  30S ribosomal protein S12  31.96 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  36.59 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  33.93 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  33.71 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  33.71 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3148  ribosomal protein S12  35.96 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  33.71 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  33.71 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  35.29 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  33.71 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1770  30S ribosomal protein S12  36.47 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_002620  TC0723  30S ribosomal protein S12  31.71 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0867606  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0332  30S ribosomal protein S12  36.56 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.75443e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  35.96 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0855  30S ribosomal protein S12  35.29 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.638007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1873  30S ribosomal protein S12  35.05 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.474423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  36.9 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  32.67 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  34.83 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  36.47 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  31.86 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  35.56 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  34.44 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  35.56 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  32.65 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  33.71 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  32.67 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  35.96 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  36 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  34.12 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  34.83 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  35.96 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  33.71 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>