More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0948 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  90.98 
 
 		 134 aa  229  8.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 135 aa  214  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 135 aa  213  8e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 133 aa  210  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 128 aa  207  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 127 aa  206  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 127 aa  206  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  204  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  204  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  203  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 122 aa  200  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 125 aa  200  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  200  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  76.42 
 
 		 124 aa  198  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  197  5e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 129 aa  197  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  197  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 127 aa  196  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  196  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  196  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  196  7e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  74.45 
 
 		 137 aa  196  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  196  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  75.61 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 127 aa  194  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  194  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 125 aa  194  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  70.29 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 135 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  194  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 122 aa  194  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  193  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 		 140 aa  193  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  193  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 128 aa  193  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 139 aa  193  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 136 aa  193  8.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 140 aa  192  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  192  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 145 aa  192  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>