More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0315 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
142 aa  285  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  85.92 
 
 
142 aa  236  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  81.38 
 
 
145 aa  231  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  83.21 
 
 
140 aa  227  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  82.48 
 
 
140 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  82.48 
 
 
140 aa  226  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  82.48 
 
 
140 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  82.48 
 
 
140 aa  226  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  82.48 
 
 
140 aa  226  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  82.48 
 
 
140 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  82.48 
 
 
140 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 
140 aa  224  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  82.35 
 
 
140 aa  222  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  80.88 
 
 
137 aa  221  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  78.42 
 
 
140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 
137 aa  215  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 
137 aa  215  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  81.68 
 
 
140 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  77.94 
 
 
137 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 
137 aa  208  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  77.94 
 
 
137 aa  206  7e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  75.91 
 
 
137 aa  206  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
126 aa  206  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
126 aa  206  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  76.12 
 
 
135 aa  204  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
139 aa  204  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
137 aa  204  4e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 
139 aa  202  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  75.18 
 
 
124 aa  201  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  75.74 
 
 
123 aa  201  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  70.92 
 
 
136 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 
125 aa  199  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 
123 aa  199  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  70.92 
 
 
135 aa  198  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
135 aa  197  3.9999999999999996e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  72.66 
 
 
128 aa  196  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  70.21 
 
 
135 aa  197  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
124 aa  196  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 
124 aa  196  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  74.26 
 
 
123 aa  196  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 
123 aa  196  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 
123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 
133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  71.13 
 
 
129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  74.81 
 
 
151 aa  194  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 
123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  74.63 
 
 
135 aa  194  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  70.71 
 
 
128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
128 aa  193  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  71.22 
 
 
137 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
128 aa  193  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 
124 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  70 
 
 
128 aa  193  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  75.74 
 
 
137 aa  194  5.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
128 aa  193  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 
123 aa  193  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
124 aa  193  7e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  71.74 
 
 
136 aa  193  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
124 aa  193  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  71.63 
 
 
135 aa  192  9e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 
124 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  74.05 
 
 
144 aa  192  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 
123 aa  192  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
123 aa  192  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
123 aa  192  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  74.05 
 
 
144 aa  192  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
124 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 
146 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  76.47 
 
 
123 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  74.05 
 
 
144 aa  191  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  76.47 
 
 
123 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  71.74 
 
 
142 aa  191  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 
123 aa  191  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  71.33 
 
 
144 aa  191  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  71.33 
 
 
144 aa  191  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
125 aa  191  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 
124 aa  190  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  70.71 
 
 
137 aa  190  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  70.5 
 
 
127 aa  190  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  71.01 
 
 
137 aa  190  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 
123 aa  190  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  70.59 
 
 
123 aa  190  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  71.74 
 
 
126 aa  190  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 
123 aa  189  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
123 aa  189  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  70 
 
 
134 aa  189  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  71.74 
 
 
126 aa  189  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 
123 aa  189  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  71.74 
 
 
126 aa  189  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
125 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  189  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
127 aa  189  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
123 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 
125 aa  188  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
126 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>