More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4449 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  100 
 
 		 142 aa  283  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  89.47 
 
 		 134 aa  244  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  89.55 
 
 		 137 aa  242  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  83.8 
 
 		 135 aa  233  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  94.21 
 
 		 137 aa  233  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  89.76 
 
 		 137 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 124 aa  227  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 127 aa  223  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  79.7 
 
 		 137 aa  214  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 126 aa  214  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  80.3 
 
 		 135 aa  213  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  81.89 
 
 		 136 aa  213  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 129 aa  212  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  80.3 
 
 		 136 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  80.45 
 
 		 135 aa  211  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  80.31 
 
 		 128 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  81.89 
 
 		 128 aa  210  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  81.89 
 
 		 128 aa  210  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  81.89 
 
 		 128 aa  210  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  210  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  80.31 
 
 		 128 aa  210  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 124 aa  209  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 127 aa  207  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  77.61 
 
 		 135 aa  207  5e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0355  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  206  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  207  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  81.75 
 
 		 127 aa  206  8e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  206  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  82.79 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  81.82 
 
 		 135 aa  205  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  204  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  204  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  80.16 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 127 aa  203  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  204  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0355  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  204  5e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000759048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  203  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  80.16 
 
 		 126 aa  203  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  80.16 
 
 		 126 aa  203  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  203  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0751  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  202  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0863  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  202  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 127 aa  201  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04528  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000336955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2104  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 154 aa  201  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  201  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08790  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.762272  normal  0.0106283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0832  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  200  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0453  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  200  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  200  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  200  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  200  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0323  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  200  6e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436822  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  200  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  199  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  199  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000813391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  199  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2194  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  199  8e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  199  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  199  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  199  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  199  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  199  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4465  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  199  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0191  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00539976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2823  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0494947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>