More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1764 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  92.7 
 
 		 137 aa  257  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  90.51 
 
 		 137 aa  254  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  88.97 
 
 		 140 aa  244  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  88.55 
 
 		 140 aa  233  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 137 aa  228  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 		 140 aa  228  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 		 140 aa  227  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 		 140 aa  227  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 137 aa  226  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 		 140 aa  227  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  226  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  226  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  226  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  226  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  226  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  226  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  226  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 		 137 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 		 137 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 		 137 aa  224  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 139 aa  223  9e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  83.58 
 
 		 135 aa  221  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  86.76 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  77.94 
 
 		 145 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 		 137 aa  209  7.999999999999999e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 142 aa  208  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  75.74 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  78.68 
 
 		 142 aa  206  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 139 aa  202  2e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  77.04 
 
 		 151 aa  199  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  74.81 
 
 		 146 aa  195  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 128 aa  194  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 123 aa  193  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 123 aa  193  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  74.63 
 
 		 135 aa  193  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 128 aa  192  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0614  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000753493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 135 aa  191  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 136 aa  190  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 125 aa  190  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 		 124 aa  190  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 		 125 aa  190  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 125 aa  190  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 136 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 123 aa  189  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 123 aa  189  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 124 aa  189  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1647  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000349263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 135 aa  188  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 124 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  73.13 
 
 		 135 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 124 aa  188  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 123 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 138 aa  187  4e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 125 aa  187  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0153  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144977  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  73.88 
 
 		 137 aa  187  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  70.92 
 
 		 141 aa  186  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 125 aa  186  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 125 aa  186  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 125 aa  186  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 126 aa  186  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  73.28 
 
 		 144 aa  186  9e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 125 aa  186  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  73.28 
 
 		 144 aa  186  9e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002297  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  72.06 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000970736  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  73.28 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 		 134 aa  186  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>