More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf315 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
138 aa  283  7e-76  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  76.47 
 
 
140 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  76.47 
 
 
140 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  76.47 
 
 
140 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
139 aa  208  2e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
137 aa  207  4e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0614  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
141 aa  205  2e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000753493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  71.74 
 
 
140 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  72.99 
 
 
137 aa  200  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 
139 aa  199  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
145 aa  197  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 
137 aa  197  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  73.13 
 
 
135 aa  197  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 
137 aa  196  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 
137 aa  196  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  72.52 
 
 
140 aa  194  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
140 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
137 aa  191  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 
144 aa  190  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 
144 aa  190  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
137 aa  188  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
137 aa  187  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  69.4 
 
 
135 aa  186  7e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  72.59 
 
 
151 aa  186  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  67.88 
 
 
137 aa  186  8e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 
146 aa  186  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  71.01 
 
 
142 aa  185  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
142 aa  182  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  69.12 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
129 aa  181  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
124 aa  180  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  67.39 
 
 
140 aa  179  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
137 aa  179  9.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  66.67 
 
 
141 aa  178  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  67.15 
 
 
128 aa  178  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 
144 aa  177  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  69.4 
 
 
144 aa  177  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  68.66 
 
 
144 aa  176  8e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  65.69 
 
 
124 aa  176  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  67.88 
 
 
125 aa  176  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 
123 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 
128 aa  175  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 
125 aa  175  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 
124 aa  175  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  66.42 
 
 
124 aa  175  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 
126 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 
126 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
137 aa  174  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  66.91 
 
 
123 aa  174  3e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
135 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  65.19 
 
 
134 aa  174  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  65.44 
 
 
124 aa  174  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
136 aa  174  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 
124 aa  174  5e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  66.18 
 
 
123 aa  173  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 
137 aa  173  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  65.69 
 
 
128 aa  173  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
123 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 
123 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  65.69 
 
 
127 aa  172  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 
123 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 
123 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  65.22 
 
 
127 aa  172  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 
123 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  66.42 
 
 
124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 
123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 
123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
123 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 
123 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 
123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  66.42 
 
 
125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  66.42 
 
 
125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0453  30S ribosomal protein S12  64.71 
 
 
124 aa  171  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  65.44 
 
 
124 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0863  30S ribosomal protein S12  63.5 
 
 
125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  64.71 
 
 
135 aa  171  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  64.93 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  61.03 
 
 
126 aa  171  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  67.16 
 
 
135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 
123 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  67.16 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  67.15 
 
 
124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  65.44 
 
 
123 aa  170  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  65.44 
 
 
123 aa  170  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 
123 aa  170  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 
123 aa  170  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  65.44 
 
 
135 aa  170  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  64.71 
 
 
125 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0230  30S ribosomal protein S12  62.5 
 
 
126 aa  170  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  66.18 
 
 
123 aa  169  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  65.44 
 
 
124 aa  169  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  64.71 
 
 
125 aa  169  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>