More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2597 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  90.51 
 
 		 137 aa  254  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  87.59 
 
 		 137 aa  249  7e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 		 140 aa  234  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  81.02 
 
 		 140 aa  224  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  81.62 
 
 		 137 aa  224  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  80.29 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  80.29 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  80.29 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  80.29 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  80.29 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  80.29 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 		 139 aa  223  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  80.29 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 137 aa  222  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 137 aa  222  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  82.44 
 
 		 140 aa  221  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 140 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 140 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  81.34 
 
 		 135 aa  219  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 		 137 aa  219  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 140 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  75.91 
 
 		 142 aa  206  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 145 aa  204  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 139 aa  204  4e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  75.18 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  76.3 
 
 		 151 aa  199  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  74.81 
 
 		 146 aa  197  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 140 aa  196  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  73.13 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 137 aa  191  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 		 135 aa  191  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 138 aa  191  4e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  73.19 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 123 aa  190  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  73.19 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0614  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 141 aa  189  7e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000753493  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 		 136 aa  190  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  70.92 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  72.52 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  72.52 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 125 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  72.52 
 
 		 144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 124 aa  187  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 124 aa  187  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 		 125 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 125 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 123 aa  187  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0275  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000516158  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 135 aa  186  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3921  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012429  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3678  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880258  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  67.88 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  70.15 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2329  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000396371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 		 125 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 125 aa  185  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 125 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 		 125 aa  186  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_009720  Xaut_1674  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  hitchhiker  0.0029615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 		 125 aa  185  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0316  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000103775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0314  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 125 aa  185  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.4670400000000002e-24  hitchhiker  0.000521064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002297  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  70.07 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000970736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00057  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0398  ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2823  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0494947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 202 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 136 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3830  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 125 aa  184  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 125 aa  184  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>