More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl624 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 137 aa  276  5e-74  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  89.71 
 
 		 139 aa  254  4e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 		 140 aa  226  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 		 140 aa  226  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  80.15 
 
 		 140 aa  226  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 140 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 140 aa  226  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 140 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 140 aa  226  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 140 aa  226  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 140 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 140 aa  225  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 140 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  78.83 
 
 		 140 aa  219  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  75.74 
 
 		 137 aa  218  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 137 aa  215  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 137 aa  215  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  78.63 
 
 		 140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  75.18 
 
 		 145 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 		 140 aa  210  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  75.91 
 
 		 137 aa  209  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 		 137 aa  209  7.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  76.47 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 138 aa  207  4e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  75.91 
 
 		 137 aa  207  4e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  77.04 
 
 		 146 aa  203  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  76.3 
 
 		 151 aa  202  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 139 aa  202  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0614  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 141 aa  201  3e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000753493  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  74.63 
 
 		 135 aa  200  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  76.47 
 
 		 142 aa  200  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  75.56 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  75.56 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  76.64 
 
 		 137 aa  197  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  72.39 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  70.29 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 123 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 123 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2435  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2118  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2157  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.949049 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 129 aa  190  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  189  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 125 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  70.15 
 
 		 137 aa  189  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 135 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 202 aa  187  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  67.15 
 
 		 125 aa  187  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1674  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  hitchhiker  0.0029615 
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  72.52 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 136 aa  187  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0981  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.808535  normal  0.0659851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 137 aa  187  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0358  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0968074  normal  0.576972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 125 aa  187  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  72.52 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 		 125 aa  187  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000813391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 127 aa  187  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2213  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  72.52 
 
 		 144 aa  187  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 124 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  186  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 		 125 aa  186  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  186  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  67.15 
 
 		 125 aa  186  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 		 125 aa  186  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1903  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  186  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120307  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1603  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 126 aa  186  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>