More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1771 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  92.7 
 
 		 137 aa  257  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  87.59 
 
 		 137 aa  249  7e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 		 140 aa  234  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 		 137 aa  229  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 		 137 aa  229  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  82.35 
 
 		 137 aa  229  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 137 aa  226  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 		 140 aa  226  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 		 140 aa  225  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 		 140 aa  225  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 137 aa  224  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 		 140 aa  225  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  224  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  224  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  224  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  224  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  224  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  224  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  83.09 
 
 		 140 aa  224  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  85.07 
 
 		 135 aa  224  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  83.97 
 
 		 140 aa  221  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 		 139 aa  218  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  85.29 
 
 		 137 aa  216  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  77.94 
 
 		 145 aa  213  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  76.47 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  77.94 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  77.94 
 
 		 142 aa  206  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  78.68 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 139 aa  203  6e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  76.3 
 
 		 151 aa  199  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  75.56 
 
 		 146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  75.37 
 
 		 135 aa  197  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 		 128 aa  196  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 123 aa  193  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 128 aa  191  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0614  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000753493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 		 129 aa  190  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 137 aa  190  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 		 135 aa  190  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 126 aa  189  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 126 aa  189  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0143  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 124 aa  189  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000877595  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 124 aa  189  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2329  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 124 aa  189  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000396371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 136 aa  189  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 124 aa  189  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06190  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529309  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4695  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00310742  unclonable  0.0000000329491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3764  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000216882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 123 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0165  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 124 aa  189  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000589821  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  71.63 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08790  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.762272  normal  0.0106283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0832  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4322  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00668981  unclonable  0.000000000093676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0153  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144977  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4281  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 124 aa  187  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000473434  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 124 aa  187  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0194  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00424917  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 127 aa  187  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0179  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00020988  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  73.28 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  73.28 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 127 aa  186  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0714  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  70.9 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0226  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  73.28 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 125 aa  186  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00057  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4465  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 124 aa  185  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0191  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 124 aa  185  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00539976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>