More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0568 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
137 aa  277  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
137 aa  277  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  94.89 
 
 
137 aa  267  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  85.29 
 
 
140 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  235  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  235  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  235  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  235  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  235  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  235  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  235  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 
140 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 
140 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 
140 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 
137 aa  229  9e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  81.02 
 
 
140 aa  228  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 
137 aa  226  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  80.15 
 
 
137 aa  224  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 
137 aa  222  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  81.34 
 
 
135 aa  219  8e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  80.92 
 
 
140 aa  219  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 
137 aa  215  1e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  75.91 
 
 
145 aa  215  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  77.21 
 
 
137 aa  215  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  79.41 
 
 
142 aa  215  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 
137 aa  214  4e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 
139 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  77.37 
 
 
139 aa  210  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 
140 aa  206  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  76.3 
 
 
151 aa  203  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  73.88 
 
 
135 aa  201  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
140 aa  201  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 
146 aa  199  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  74.45 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0614  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 
141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000753493  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 
138 aa  196  7e-50  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
128 aa  196  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
124 aa  193  6e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 
144 aa  190  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 
144 aa  190  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 
128 aa  189  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  187  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 
125 aa  186  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
137 aa  186  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  186  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  70.9 
 
 
122 aa  186  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  71.97 
 
 
144 aa  185  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
124 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  71.97 
 
 
144 aa  185  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  71.97 
 
 
144 aa  185  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
129 aa  185  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 
126 aa  185  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 
124 aa  184  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0332  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 
124 aa  184  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.75443e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  184  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  69.85 
 
 
142 aa  184  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
123 aa  184  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  67.88 
 
 
128 aa  184  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0453  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 
124 aa  184  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1859  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 
140 aa  184  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000297311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
123 aa  183  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0449  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245069  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0621  ribosomal protein S12  69.12 
 
 
123 aa  183  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0467971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4553  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
123 aa  183  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4754  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0069971  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  71.32 
 
 
123 aa  183  6e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  183  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0482  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00887343  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  72.79 
 
 
123 aa  183  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
135 aa  183  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
137 aa  182  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 
125 aa  183  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5084  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000372419  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0290  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000638987  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0479  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135027  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0416  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 
124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00364585  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  67.88 
 
 
124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4281  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000473434  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0165  30S ribosomal protein S12  66.42 
 
 
124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000589821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  67.88 
 
 
126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  67.88 
 
 
126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 
136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2174  ribosomal protein S12  69.12 
 
 
125 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.123269  normal  0.537249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  70.15 
 
 
122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  67.88 
 
 
124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
136 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  181  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  64.96 
 
 
127 aa  181  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  66.42 
 
 
124 aa  181  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
124 aa  181  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
124 aa  181  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>