More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0189 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 122 aa  244  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  81.82 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 123 aa  204  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 124 aa  203  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 125 aa  203  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 127 aa  201  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 136 aa  201  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 127 aa  201  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  83.47 
 
 		 122 aa  201  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 125 aa  199  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 125 aa  199  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  79.34 
 
 		 126 aa  197  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  79.34 
 
 		 126 aa  197  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 128 aa  196  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  76.67 
 
 		 125 aa  196  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  79.34 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  77.5 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  84.3 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 128 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 135 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 135 aa  194  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 135 aa  193  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  76.67 
 
 		 124 aa  193  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1603  30S ribosomal protein S12  76.67 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16911  30S ribosomal protein S12  76.67 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17141  30S ribosomal protein S12  76.67 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1800  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278795  normal  0.143842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 133 aa  192  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1770  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 128 aa  191  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  76.86 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  74.38 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 126 aa  191  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  77.5 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  73.13 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  74.38 
 
 		 134 aa  191  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2329  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 124 aa  190  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000396371  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 126 aa  190  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  73.13 
 
 		 137 aa  190  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 125 aa  190  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  77.5 
 
 		 124 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 124 aa  190  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 125 aa  190  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0290  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 124 aa  190  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000638987  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 125 aa  190  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 125 aa  190  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  73.55 
 
 		 123 aa  189  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  73.55 
 
 		 123 aa  189  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>