More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01120 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  100 
 
 		 123 aa  243  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 124 aa  216  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 124 aa  214  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 125 aa  215  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 124 aa  213  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  84.43 
 
 		 123 aa  213  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  213  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 135 aa  213  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  213  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 128 aa  212  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  212  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  211  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  81.82 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  81.82 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  81.82 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 135 aa  207  3e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  207  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  207  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 126 aa  207  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 126 aa  207  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  207  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  81.15 
 
 		 134 aa  206  6e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  206  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  206  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  76.64 
 
 		 140 aa  206  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  84.3 
 
 		 122 aa  206  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  206  9e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 136 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 133 aa  205  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  83.47 
 
 		 122 aa  204  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 127 aa  203  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  203  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  79.41 
 
 		 137 aa  202  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  202  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  202  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  201  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 127 aa  201  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  200  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  200  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  200  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  78.05 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 128 aa  199  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  80.49 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 127 aa  198  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 137 aa  198  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1897  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  198  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113502  normal  0.324769 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 127 aa  198  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2187  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  198  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  75.74 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17141  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0290  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000638987  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1603  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 128 aa  197  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  79.34 
 
 		 122 aa  197  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 125 aa  197  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1863  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  197  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000968975  normal  0.252117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2329  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  196  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000396371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  196  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  196  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16911  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  197  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0453  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  196  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 135 aa  197  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 123 aa  196  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2174  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  196  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.123269  normal  0.537249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  196  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  196  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00057  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  196  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002297  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  79.67 
 
 		 124 aa  196  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000970736  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 129 aa  196  9e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 125 aa  196  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>