More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0958 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  89.43 
 
 		 123 aa  224  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  88.62 
 
 		 124 aa  223  5.0000000000000005e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  209  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 135 aa  207  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  206  8e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  81.3 
 
 		 124 aa  206  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 139 aa  203  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 122 aa  204  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  203  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  203  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  202  9e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  76.23 
 
 		 134 aa  201  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 133 aa  201  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  200  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  200  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 135 aa  200  5e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  200  7e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  197  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  76.23 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5119  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  196  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  196  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  196  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 128 aa  196  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  196  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  195  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3148  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  195  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  194  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  74.8 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  76.42 
 
 		 124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 142 aa  193  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00057  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  193  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002297  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  76.42 
 
 		 124 aa  193  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000970736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2771  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000785263  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 125 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  191  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 127 aa  191  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1647  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000349263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03193  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000163524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0371  ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.72822e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 123 aa  190  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3716  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000501374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 123 aa  190  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3759  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000474528  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3718  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000740519  normal  0.0746879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3816  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000929578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3538  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.3416399999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 123 aa  190  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4651  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000289179  normal  0.0331168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3645  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03144  hypothetical protein  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000164791  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3753  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00207543  normal  0.0353577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3811  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000707874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3644  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000993601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0371  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000085622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3623  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000437781  hitchhiker  0.00102152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  190  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  190  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 136 aa  190  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>