More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0260 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 135 aa  268  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  86.67 
 
 		 135 aa  236  6.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  87.7 
 
 		 134 aa  221  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 124 aa  214  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  213  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  212  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  75.56 
 
 		 135 aa  209  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  80.95 
 
 		 128 aa  208  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 		 136 aa  208  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 133 aa  207  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  77.37 
 
 		 137 aa  207  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 124 aa  206  7e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  206  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  206  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  75.37 
 
 		 134 aa  205  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  75.76 
 
 		 136 aa  204  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  204  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  77.34 
 
 		 128 aa  204  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  75.37 
 
 		 137 aa  204  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  77.34 
 
 		 128 aa  204  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  203  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  203  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  203  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  76.56 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  76.56 
 
 		 129 aa  202  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  77.95 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  78.4 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  76.56 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  76.56 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  201  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  201  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  76.42 
 
 		 124 aa  201  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  200  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  72.66 
 
 		 140 aa  200  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  200  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  200  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 122 aa  199  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2962  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 202 aa  199  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 127 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 127 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 125 aa  199  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0981  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.808535  normal  0.0659851 
 
 
-
 
NC_004310  BR1238  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1201  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.449722  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  76.19 
 
 		 127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1950  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  75.81 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  72.92 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0355  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  198  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  197  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1327  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  198  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139307  normal  0.0632073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1425  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  198  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469141  normal  0.0235591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 125 aa  197  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1951  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000165732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1674  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  hitchhiker  0.0029615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  76.23 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  76 
 
 		 137 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  73.6 
 
 		 126 aa  197  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  74.4 
 
 		 125 aa  197  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  197  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  197  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>