More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0301 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 124 aa  245  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  93.55 
 
 		 124 aa  234  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  93.55 
 
 		 124 aa  234  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  94.35 
 
 		 124 aa  234  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  93.55 
 
 		 124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  91.94 
 
 		 124 aa  231  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  93.5 
 
 		 124 aa  231  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  93.5 
 
 		 124 aa  231  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  93.5 
 
 		 139 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  91.94 
 
 		 124 aa  231  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  91.13 
 
 		 124 aa  229  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  92.68 
 
 		 123 aa  229  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  91.13 
 
 		 124 aa  229  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  91.94 
 
 		 124 aa  229  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  92.56 
 
 		 122 aa  229  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  91.87 
 
 		 124 aa  228  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  91.06 
 
 		 123 aa  227  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5119  ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 123 aa  227  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  89.52 
 
 		 124 aa  226  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  92.68 
 
 		 124 aa  226  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  89.52 
 
 		 124 aa  226  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 123 aa  226  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  91.13 
 
 		 124 aa  224  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  91.13 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  90.32 
 
 		 124 aa  223  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  90.32 
 
 		 124 aa  223  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3148  ribosomal protein S12  88.62 
 
 		 124 aa  221  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  91.06 
 
 		 124 aa  222  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  89.52 
 
 		 124 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  89.52 
 
 		 124 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  89.52 
 
 		 124 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  90.91 
 
 		 123 aa  219  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 124 aa  217  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 124 aa  217  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  84.55 
 
 		 124 aa  216  8.999999999999998e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 123 aa  214  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  86.18 
 
 		 124 aa  214  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 124 aa  213  9e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 136 aa  208  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 128 aa  204  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 127 aa  204  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 127 aa  204  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  204  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  204  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 126 aa  203  6e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  203  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 135 aa  203  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 136 aa  202  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 135 aa  202  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  201  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  201  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 135 aa  201  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 125 aa  201  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 129 aa  201  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  201  4e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  79.03 
 
 		 124 aa  201  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  200  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  200  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  200  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 123 aa  199  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  200  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  200  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  200  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  199  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  199  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>