More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1615 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1615  30S ribosomal protein S12P  100 
 
 		 142 aa  283  5.999999999999999e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0265  30S ribosomal protein S12P  81.69 
 
 		 142 aa  234  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0281  30S ribosomal protein S12P  78.87 
 
 		 142 aa  227  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0382587  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2830  30S ribosomal protein S12P  80.28 
 
 		 142 aa  226  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2207  30S ribosomal protein S12P  79.58 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.513202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3688  30S ribosomal protein S12P  72.54 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0070  ribosomal protein S23 (S12)  71.13 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000707157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1173  30S ribosomal protein S12P  71.83 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000030185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0358  ribosomal protein S23 (S12)  70.42 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0101  30S ribosomal protein S12P  70.42 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.322935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2383  30S ribosomal protein S12P  69.72 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2157  ribosomal protein S23 (S12)  69.72 
 
 		 142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0510  30S ribosomal protein S12P  69.72 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0033  30S ribosomal protein S12P  74.26 
 
 		 140 aa  193  8.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0211  30S ribosomal protein S12P  67.86 
 
 		 147 aa  185  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0612  30S ribosomal protein S12P  67.14 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1306  30S ribosomal protein S12P  67.14 
 
 		 147 aa  183  7e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0281  30S ribosomal protein S12P  64.29 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0354  30S ribosomal protein S12P  67.63 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0038  30S ribosomal protein S12P  62.86 
 
 		 146 aa  180  7e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000314149  normal  0.098925 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0785  30S ribosomal protein S12P  66.43 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0677  30S ribosomal protein S12P  65 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1199  ribosomal protein S23 (S12)  62.86 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1968  30S ribosomal protein S12P  61.15 
 
 		 147 aa  167  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000106893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2096  30S ribosomal protein S12P  60.43 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2326  30S ribosomal protein S12P  60.43 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000138324  hitchhiker  0.00000152235 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0698  30S ribosomal protein S12P  60.43 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00910489  normal  0.0527609 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01345  40S ribosomal protein S23 (Broad)  56.55 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04360  40s ribosomal protein s23, putative  57.78 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203835  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87868  predicted protein  53.1 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50701  predicted protein  52.52 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32119  Ribosomal protein S23, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  53.33 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0872909  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  59.21 
 
 		 661 aa  94.4  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  36.45 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  37.11 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  41.05 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86106  conserved hypothetical protein  41.18 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377423  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  38.14 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  38.38 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  36.08 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0332  30S ribosomal protein S12  40 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.75443e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  39.33 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  36.7 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  36.7 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  37.11 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  35.45 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1859  30S ribosomal protein S12  40 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000297311  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  37.11 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  35.51 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1873  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.474423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  35.51 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  38.2 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  35.51 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0159  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000153549  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  36.08 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  35.51 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0230  30S ribosomal protein S12  34.74 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  37.76 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  38.46 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  36.84 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  36.46 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  36.84 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1897  30S ribosomal protein S12  36.56 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113502  normal  0.324769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  34.58 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2187  30S ribosomal protein S12  36.56 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0492  30S ribosomal protein S12  37.63 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  35.79 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  36.84 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  39.33 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  36.84 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0963  30S ribosomal protein S12  35.63 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  38.75 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  34.74 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  36.84 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  33.08 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  37.08 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  37.36 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  37.36 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  38.2 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  35 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  37.36 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  37.93 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  38.2 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  36.84 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  37.37 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  37.37 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>