More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_87868 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_87868  predicted protein  100 
 
 		 145 aa  290  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01345  40S ribosomal protein S23 (Broad)  87.59 
 
 		 145 aa  264  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04360  40s ribosomal protein s23, putative  83.45 
 
 		 145 aa  251  3e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203835  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50701  predicted protein  75.35 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32119  Ribosomal protein S23, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  76.06 
 
 		 142 aa  216  6e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0872909  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0070  ribosomal protein S23 (S12)  60.58 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000707157  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1199  ribosomal protein S23 (S12)  57.55 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2096  30S ribosomal protein S12P  58.74 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0354  30S ribosomal protein S12P  60.71 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0038  30S ribosomal protein S12P  54.86 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000314149  normal  0.098925 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1968  30S ribosomal protein S12P  56.64 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000106893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0281  30S ribosomal protein S12P  56.64 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2207  30S ribosomal protein S12P  57.93 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.513202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0510  30S ribosomal protein S12P  59.12 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2157  ribosomal protein S23 (S12)  58.39 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1173  30S ribosomal protein S12P  55.71 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000030185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0033  30S ribosomal protein S12P  56.93 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0101  30S ribosomal protein S12P  57.66 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.322935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2383  30S ribosomal protein S12P  56.93 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3688  30S ribosomal protein S12P  55.86 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0358  ribosomal protein S23 (S12)  57.66 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0698  30S ribosomal protein S12P  55.24 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00910489  normal  0.0527609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2326  30S ribosomal protein S12P  55.24 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000138324  hitchhiker  0.00000152235 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0281  30S ribosomal protein S12P  55.17 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0382587  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0265  30S ribosomal protein S12P  54.48 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1306  30S ribosomal protein S12P  52.11 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2830  30S ribosomal protein S12P  54.48 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0612  30S ribosomal protein S12P  51.41 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0677  30S ribosomal protein S12P  51.41 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0211  30S ribosomal protein S12P  50.7 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0785  30S ribosomal protein S12P  50.69 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1615  30S ribosomal protein S12P  53.1 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729844 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  63.51 
 
 		 661 aa  90.9  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  36.67 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  35.56 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  39.81 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  36.67 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  39.02 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86106  conserved hypothetical protein  33.98 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377423  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0230  30S ribosomal protein S12  34.21 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  36.59 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  37.74 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  37.36 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  32.69 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  34.83 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  36.26 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  39.02 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  33.63 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  39.02 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  36.26 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  35.23 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  34.83 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  35.23 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  33.63 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  31.86 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  34.83 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  34.83 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  33.63 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  34.83 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  35.23 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  34.83 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  37.8 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  33.65 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  35.58 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  36.56 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  37.5 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  37.8 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01910  ribosomal protein S12, putative  35.37 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.185549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  34.62 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  36.26 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  35.05 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 124 aa  50.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  33.65 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  35.24 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  35.23 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  34.09 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  39.02 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  37.8 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  34.02 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>