More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2207 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2207  30S ribosomal protein S12P  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.513202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0265  30S ribosomal protein S12P  86.62 
 
 		 142 aa  247  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0281  30S ribosomal protein S12P  85.21 
 
 		 142 aa  246  7e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0382587  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2830  30S ribosomal protein S12P  84.51 
 
 		 142 aa  240  6e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1173  30S ribosomal protein S12P  77.46 
 
 		 142 aa  225  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000030185  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1615  30S ribosomal protein S12P  79.58 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729844 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3688  30S ribosomal protein S12P  76.76 
 
 		 142 aa  218  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0070  ribosomal protein S23 (S12)  74.65 
 
 		 142 aa  210  7e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000707157  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0358  ribosomal protein S23 (S12)  72.54 
 
 		 142 aa  207  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0510  30S ribosomal protein S12P  72.54 
 
 		 142 aa  207  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2383  30S ribosomal protein S12P  71.83 
 
 		 142 aa  207  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0033  30S ribosomal protein S12P  77.21 
 
 		 140 aa  206  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2157  ribosomal protein S23 (S12)  71.83 
 
 		 142 aa  206  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0101  30S ribosomal protein S12P  71.13 
 
 		 142 aa  203  8e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.322935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1306  30S ribosomal protein S12P  69.78 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0211  30S ribosomal protein S12P  69.06 
 
 		 147 aa  190  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0612  30S ribosomal protein S12P  69.06 
 
 		 147 aa  189  8e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0354  30S ribosomal protein S12P  68.35 
 
 		 145 aa  187  4e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0677  30S ribosomal protein S12P  68.35 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0281  30S ribosomal protein S12P  65.47 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0785  30S ribosomal protein S12P  66.91 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1968  30S ribosomal protein S12P  64.75 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000106893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0038  30S ribosomal protein S12P  62.59 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000314149  normal  0.098925 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2096  30S ribosomal protein S12P  64.03 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2326  30S ribosomal protein S12P  64.03 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000138324  hitchhiker  0.00000152235 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1199  ribosomal protein S23 (S12)  61.15 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0698  30S ribosomal protein S12P  64.03 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00910489  normal  0.0527609 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01345  40S ribosomal protein S23 (Broad)  60 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87868  predicted protein  57.93 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04360  40s ribosomal protein s23, putative  61.48 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203835  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50701  predicted protein  55.4 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32119  Ribosomal protein S23, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  55.56 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0872909  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  64.47 
 
 		 661 aa  100  9e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  42.27 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  41.57 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  42.7 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  41.57 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0332  30S ribosomal protein S12  43.96 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.75443e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  42.86 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  37.37 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  41.57 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  39.18 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1859  30S ribosomal protein S12  43.96 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000297311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  38.38 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  40.45 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  42.35 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  38.14 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86106  conserved hypothetical protein  42.35 
 
 		 177 aa  57  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377423  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  40.82 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  39.18 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  37.63 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  40.45 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  40.45 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0492  30S ribosomal protein S12  43.21 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  43.82 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  40.21 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0723  30S ribosomal protein S12  38.78 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0867606  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2174  ribosomal protein S12  42.53 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.123269  normal  0.537249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  39.18 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  40.23 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  38.14 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  40.21 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  40.45 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  39.18 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  39.18 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  40.45 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  40.91 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  38.14 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  38.3 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1770  30S ribosomal protein S12  41.18 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  42.17 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  37.11 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  43.21 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  38.2 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  40 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2779  ribosomal protein S12  40 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0598537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03193  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000163524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0371  ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.72822e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3645  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  37.11 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3716  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000501374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3811  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000707874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4551  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187962  normal  0.158783 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3644  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000993601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0310  30S ribosomal protein S12  43.21 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00417807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3538  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.3416399999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3816  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000929578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4651  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000289179  normal  0.0331168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3718  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000740519  normal  0.0746879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3830  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00057  30S ribosomal protein S12  43.21 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3753  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00207543  normal  0.0353577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>