More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0723 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0723  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0867606  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  196  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  196  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  196  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  196  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  196  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  196  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  196  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0308  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 127 aa  196  7.999999999999999e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000773303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  196  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  196  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  194  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  194  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  194  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  194  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  193  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  192  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  192  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  192  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 202 aa  192  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1425  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469141  normal  0.0235591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1327  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139307  normal  0.0632073 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0981  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.808535  normal  0.0659851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1674  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  hitchhiker  0.0029615 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 125 aa  190  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0314  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  190  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.4670400000000002e-24  hitchhiker  0.000521064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_004310  BR1238  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000378884  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5075  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27607  normal  0.189155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1201  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.449722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1951  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000165732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2290  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 127 aa  189  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3453  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3189  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2104  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 127 aa  188  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3672  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 135 aa  187  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1359  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.604164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1540  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0355  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 126 aa  187  5e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  73.17 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0751  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1800  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  187  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278795  normal  0.143842 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0661  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  186  7e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291952  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0693  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  186  7e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000127901  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  186  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1647  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000349263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2194  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 128 aa  185  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04528  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000336955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 125 aa  186  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3830  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4010  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000175361  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0226  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4551  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187962  normal  0.158783 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3678  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0195  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00503179  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  69.92 
 
 		 123 aa  184  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4061  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000816625  hitchhiker  0.00000101857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0194  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0259871  hitchhiker  0.00000480785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0189  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.019095  decreased coverage  0.000333311 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4465  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0191  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00539976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0275  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000516158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>