More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0265 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0265  30S ribosomal protein S12P  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0281  30S ribosomal protein S12P  92.96 
 
 		 142 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0382587  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2830  30S ribosomal protein S12P  87.32 
 
 		 142 aa  254  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2207  30S ribosomal protein S12P  86.62 
 
 		 142 aa  247  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.513202  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1615  30S ribosomal protein S12P  81.69 
 
 		 142 aa  234  4e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1173  30S ribosomal protein S12P  74.65 
 
 		 142 aa  216  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000030185  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0070  ribosomal protein S23 (S12)  75.35 
 
 		 142 aa  213  5.9999999999999996e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000707157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3688  30S ribosomal protein S12P  73.24 
 
 		 142 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0033  30S ribosomal protein S12P  77.94 
 
 		 140 aa  210  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0101  30S ribosomal protein S12P  72.54 
 
 		 142 aa  203  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.322935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2383  30S ribosomal protein S12P  71.13 
 
 		 142 aa  202  9e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2157  ribosomal protein S23 (S12)  71.83 
 
 		 142 aa  202  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0510  30S ribosomal protein S12P  71.13 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0358  ribosomal protein S23 (S12)  71.13 
 
 		 142 aa  200  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0354  30S ribosomal protein S12P  69.06 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0281  30S ribosomal protein S12P  67.14 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0038  30S ribosomal protein S12P  65 
 
 		 146 aa  186  9e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000314149  normal  0.098925 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0211  30S ribosomal protein S12P  65.71 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0612  30S ribosomal protein S12P  65 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1306  30S ribosomal protein S12P  65 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1199  ribosomal protein S23 (S12)  64.29 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0677  30S ribosomal protein S12P  65.71 
 
 		 147 aa  179  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1968  30S ribosomal protein S12P  63.31 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000106893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0785  30S ribosomal protein S12P  64.29 
 
 		 147 aa  173  6e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2096  30S ribosomal protein S12P  62.59 
 
 		 147 aa  173  7e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2326  30S ribosomal protein S12P  62.59 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000138324  hitchhiker  0.00000152235 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0698  30S ribosomal protein S12P  62.59 
 
 		 147 aa  160  7e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00910489  normal  0.0527609 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01345  40S ribosomal protein S23 (Broad)  57.93 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04360  40s ribosomal protein s23, putative  60 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203835  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87868  predicted protein  54.48 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32119  Ribosomal protein S23, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  54.07 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0872909  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50701  predicted protein  52.59 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  60.53 
 
 		 661 aa  96.3  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  43.16 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  39.18 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  40.38 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  43.68 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  46.25 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  43.02 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  44.71 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  43.37 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  41.05 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0332  30S ribosomal protein S12  45.98 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.75443e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  41.38 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  38.14 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1859  30S ribosomal protein S12  45.98 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000297311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  40.82 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  40.86 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  42.53 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  43.37 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  40.43 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  42.35 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  38.71 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86106  conserved hypothetical protein  42.35 
 
 		 177 aa  57  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377423  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0492  30S ribosomal protein S12  43.21 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  41.94 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  38.71 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  42.35 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  38.95 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0127  30S ribosomal protein S12  32.98 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  38.14 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  39.78 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  40.23 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  40 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  37.72 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  39.78 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  41.05 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  38.71 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  40 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1770  30S ribosomal protein S12  43.21 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2174  ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.123269  normal  0.537249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  38.39 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  41.38 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4010  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000175361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  38.71 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  39.78 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0275  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000516158  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  39.78 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  39.78 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  41.18 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  39.78 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  39.78 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3921  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012429  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  39.78 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  39.78 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3678  30S ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  39.18 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  37.5 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  39.18 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  40.96 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  41.38 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>