More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32119 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009360  OSTLU_32119  Ribosomal protein S23, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 		 142 aa  285  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0872909  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50701  predicted protein  79.72 
 
 		 143 aa  222  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87868  predicted protein  76.06 
 
 		 145 aa  216  6e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04360  40s ribosomal protein s23, putative  77.3 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203835  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01345  40S ribosomal protein S23 (Broad)  75.35 
 
 		 145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0354  30S ribosomal protein S12P  60.87 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0070  ribosomal protein S23 (S12)  56.93 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000707157  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2157  ribosomal protein S23 (S12)  58.96 
 
 		 142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0038  30S ribosomal protein S12P  53.57 
 
 		 146 aa  149  8.999999999999999e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000314149  normal  0.098925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0358  ribosomal protein S23 (S12)  58.21 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0510  30S ribosomal protein S12P  59.7 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2096  30S ribosomal protein S12P  56.93 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1199  ribosomal protein S23 (S12)  52.9 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0101  30S ribosomal protein S12P  57.46 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.322935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1968  30S ribosomal protein S12P  56.93 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000106893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0281  30S ribosomal protein S12P  53.62 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2383  30S ribosomal protein S12P  56.72 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1173  30S ribosomal protein S12P  54.07 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000030185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0033  30S ribosomal protein S12P  53.28 
 
 		 140 aa  141  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3688  30S ribosomal protein S12P  52.52 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2207  30S ribosomal protein S12P  55.56 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.513202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0265  30S ribosomal protein S12P  54.07 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0698  30S ribosomal protein S12P  55.47 
 
 		 147 aa  137  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00910489  normal  0.0527609 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2830  30S ribosomal protein S12P  56.3 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0281  30S ribosomal protein S12P  54.07 
 
 		 142 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0382587  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1306  30S ribosomal protein S12P  54.14 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2326  30S ribosomal protein S12P  54.74 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000138324  hitchhiker  0.00000152235 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0785  30S ribosomal protein S12P  53.33 
 
 		 147 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0612  30S ribosomal protein S12P  53.38 
 
 		 147 aa  133  9e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0211  30S ribosomal protein S12P  52.63 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1615  30S ribosomal protein S12P  53.33 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0677  30S ribosomal protein S12P  51.88 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  62.16 
 
 		 661 aa  88.6  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86106  conserved hypothetical protein  42.55 
 
 		 177 aa  57  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377423  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  38.54 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  39.29 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  38.83 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  37.21 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  37.11 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01910  ribosomal protein S12, putative  36.59 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.185549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  38.1 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  36.59 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0332  30S ribosomal protein S12  36.56 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.75443e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  36.73 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  38.55 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  36.9 
 
 		 124 aa  50.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  37.76 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  34.74 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  37.21 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0127  30S ribosomal protein S12  29.76 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  34.74 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  37.63 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  37.8 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1770  30S ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  37.35 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  33.01 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  31.63 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2962  30S ribosomal protein S12  34.52 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1859  30S ribosomal protein S12  35.48 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000297311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  37.35 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2070  ribosomal protein S12  35.8 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000016917  normal  0.605238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  38.55 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  33.01 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1950  30S ribosomal protein S12  34.52 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0837  ribosomal protein S12  34.88 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.443392  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  40.26 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  37.66 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  34.52 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  37.04 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  37.8 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  36.56 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2779  ribosomal protein S12  34.57 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0598537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0230  30S ribosomal protein S12  33.64 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  37.8 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1831  ribosomal protein S12  36 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.658439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  35.16 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  37.04 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  33.67 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  36.05 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  34.88 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  34.88 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  34.52 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 124 aa  48.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  34.52 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  36.26 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  35.8 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0308  30S ribosomal protein S12  33.98 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000773303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  33.33 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0575  30S ribosomal protein S12  34.52 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.962051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  36.26 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  33.04 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  37.04 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>