More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0308 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0308  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 127 aa  256  9e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000773303  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  81.6 
 
 		 125 aa  204  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 126 aa  203  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 126 aa  203  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 126 aa  203  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 126 aa  203  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  82.68 
 
 		 127 aa  203  7e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 		 125 aa  203  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  79.2 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 126 aa  201  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  79.2 
 
 		 126 aa  200  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 125 aa  200  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 125 aa  200  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 125 aa  200  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0230  30S ribosomal protein S12  81.6 
 
 		 126 aa  200  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  79.2 
 
 		 125 aa  199  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  81.75 
 
 		 128 aa  199  8e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  81.75 
 
 		 128 aa  199  8e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  81.75 
 
 		 128 aa  199  8e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2104  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  197  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04528  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000336955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2194  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  79.2 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  78.4 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  78.4 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  197  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0751  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  196  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0314  30S ribosomal protein S12  77.6 
 
 		 125 aa  196  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.4670400000000002e-24  hitchhiker  0.000521064 
 
 
-
 
NC_002620  TC0723  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  196  7.999999999999999e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0867606  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  77.6 
 
 		 125 aa  195  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000378884  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 126 aa  194  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0863  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  78.4 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0165  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000589821  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  80.31 
 
 		 127 aa  195  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  79.53 
 
 		 127 aa  195  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0143  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000877595  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  77.95 
 
 		 128 aa  194  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 134 aa  194  4.0000000000000005e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 137 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1897  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  194  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113502  normal  0.324769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4695  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00310742  unclonable  0.0000000329491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  76.19 
 
 		 128 aa  194  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2187  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  194  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 125 aa  194  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0194  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00424917  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3764  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  193  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000216882  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0600  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  193  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00583114  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0290  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  193  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000638987  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4322  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  192  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00668981  unclonable  0.000000000093676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2329  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000396371  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  77.78 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0179  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00020988  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00698  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000175527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0226  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1863  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000968975  normal  0.252117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0153  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144977  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0194  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0259871  hitchhiker  0.00000480785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0189  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.019095  decreased coverage  0.000333311 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0355  ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  191  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000759048  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  76 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4061  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000816625  hitchhiker  0.00000101857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0191  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00539976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0837  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.443392  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4465  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0195  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00503179  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 126 aa  190  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 126 aa  190  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  190  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0453  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  190  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>