More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1173 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1173  30S ribosomal protein S12P  100 
 
 		 142 aa  289  8e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000030185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3688  30S ribosomal protein S12P  85.21 
 
 		 142 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2207  30S ribosomal protein S12P  77.46 
 
 		 142 aa  225  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.513202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0281  30S ribosomal protein S12P  76.06 
 
 		 142 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0382587  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0033  30S ribosomal protein S12P  77.7 
 
 		 140 aa  216  7e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0265  30S ribosomal protein S12P  74.65 
 
 		 142 aa  216  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2830  30S ribosomal protein S12P  71.13 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0358  ribosomal protein S23 (S12)  69.72 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2383  30S ribosomal protein S12P  69.72 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0510  30S ribosomal protein S12P  69.72 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2157  ribosomal protein S23 (S12)  69.01 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0101  30S ribosomal protein S12P  69.72 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.322935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1615  30S ribosomal protein S12P  71.83 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729844 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0070  ribosomal protein S23 (S12)  68.31 
 
 		 142 aa  199  9e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000707157  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0354  30S ribosomal protein S12P  67.38 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1306  30S ribosomal protein S12P  63.83 
 
 		 147 aa  185  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0211  30S ribosomal protein S12P  63.83 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0612  30S ribosomal protein S12P  63.12 
 
 		 147 aa  183  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0281  30S ribosomal protein S12P  62.41 
 
 		 147 aa  184  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0677  30S ribosomal protein S12P  63.83 
 
 		 147 aa  183  7e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0785  30S ribosomal protein S12P  63.12 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2096  30S ribosomal protein S12P  60.28 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1968  30S ribosomal protein S12P  59.57 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000106893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0038  30S ribosomal protein S12P  58.16 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000314149  normal  0.098925 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1199  ribosomal protein S23 (S12)  58.87 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2326  30S ribosomal protein S12P  60.28 
 
 		 147 aa  169  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000138324  hitchhiker  0.00000152235 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0698  30S ribosomal protein S12P  60.28 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00910489  normal  0.0527609 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01345  40S ribosomal protein S23 (Broad)  58.57 
 
 		 145 aa  163  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87868  predicted protein  55.71 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04360  40s ribosomal protein s23, putative  57.14 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203835  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50701  predicted protein  52.86 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32119  Ribosomal protein S23, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  54.07 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0872909  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  61.84 
 
 		 661 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  40.62 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  38.78 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  39.77 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  41.67 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  42.05 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  38.78 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  40.91 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  37.76 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  36 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  40.91 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  38.2 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  38.2 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  40.91 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  38.2 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  38.2 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  38.2 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  38.2 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  40.91 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  40.91 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  38.64 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  37.36 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  41.67 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  38.64 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  41.67 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  38.64 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  36.73 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  38.64 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  37.8 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  34.82 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0127  30S ribosomal protein S12  30.21 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  41.67 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  36.46 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  35.42 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  34.82 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  37.63 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  40.48 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  34.82 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  34.86 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  38.64 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  36.36 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  38.64 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  39.29 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  39.08 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  34.38 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  39.29 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86106  conserved hypothetical protein  38.64 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377423  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  37.35 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  36.46 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  34.38 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  39.29 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>