More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3688 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3688  30S ribosomal protein S12P  100 
 
 		 142 aa  287  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1173  30S ribosomal protein S12P  85.21 
 
 		 142 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000030185  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2207  30S ribosomal protein S12P  76.76 
 
 		 142 aa  218  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.513202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0281  30S ribosomal protein S12P  73.24 
 
 		 142 aa  216  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0382587  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0033  30S ribosomal protein S12P  77.7 
 
 		 140 aa  215  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0265  30S ribosomal protein S12P  73.24 
 
 		 142 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2830  30S ribosomal protein S12P  70.42 
 
 		 142 aa  206  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1615  30S ribosomal protein S12P  72.54 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729844 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0358  ribosomal protein S23 (S12)  69.01 
 
 		 142 aa  204  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2157  ribosomal protein S23 (S12)  68.31 
 
 		 142 aa  202  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0510  30S ribosomal protein S12P  69.01 
 
 		 142 aa  202  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2383  30S ribosomal protein S12P  68.31 
 
 		 142 aa  201  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0101  30S ribosomal protein S12P  68.31 
 
 		 142 aa  199  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.322935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0070  ribosomal protein S23 (S12)  66.9 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000707157  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0354  30S ribosomal protein S12P  66.91 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0677  30S ribosomal protein S12P  64.29 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1306  30S ribosomal protein S12P  62.86 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0211  30S ribosomal protein S12P  62.86 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0785  30S ribosomal protein S12P  62.86 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0612  30S ribosomal protein S12P  62.14 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0281  30S ribosomal protein S12P  60 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2096  30S ribosomal protein S12P  60.43 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0038  30S ribosomal protein S12P  59.29 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000314149  normal  0.098925 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1968  30S ribosomal protein S12P  59.71 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000106893  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1199  ribosomal protein S23 (S12)  59.29 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2326  30S ribosomal protein S12P  59.71 
 
 		 147 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000138324  hitchhiker  0.00000152235 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0698  30S ribosomal protein S12P  59.71 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00910489  normal  0.0527609 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01345  40S ribosomal protein S23 (Broad)  57.93 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87868  predicted protein  55.86 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04360  40s ribosomal protein s23, putative  56.83 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203835  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50701  predicted protein  54.96 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32119  Ribosomal protein S23, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  52.52 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0872909  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  61.84 
 
 		 661 aa  101  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  40.62 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  38.14 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  38.14 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0127  30S ribosomal protein S12  33.33 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  39.18 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  41.98 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  39.58 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  42.17 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  39.08 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86106  conserved hypothetical protein  33.62 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377423  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  37.11 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  37.11 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  38.64 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  33.33 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  36.46 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  39.51 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  40.21 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  37.5 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  39.08 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  40.21 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  37.11 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  40.23 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  37.78 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  36.46 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  36.46 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  35.42 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  40.96 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  40.96 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  38.64 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  40.23 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  38.54 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  35.42 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  34.38 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  39.51 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  39.08 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  40.7 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  38.64 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  41.38 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0585  30S ribosomal protein S12  36.78 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.940946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  36.46 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  39.08 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  37.5 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  37.93 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  37.93 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  36.46 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  36.46 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1950  30S ribosomal protein S12  35.42 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  36.46 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  36.46 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>