More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86106 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_86106  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  360  5.0000000000000005e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377423  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  61.29 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1897  30S ribosomal protein S12  60 
 
 		 124 aa  149  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113502  normal  0.324769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  66.04 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2187  30S ribosomal protein S12  60 
 
 		 124 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  67.62 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  60.48 
 
 		 142 aa  148  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0230  30S ribosomal protein S12  60.48 
 
 		 126 aa  148  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  66.04 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  59.68 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  63.55 
 
 		 137 aa  147  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4010  30S ribosomal protein S12  58.87 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000175361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  59.68 
 
 		 123 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3830  30S ribosomal protein S12  58.87 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1647  30S ribosomal protein S12  58.14 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000349263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  59.2 
 
 		 124 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3678  30S ribosomal protein S12  64.76 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0398  ribosomal protein S12  58.87 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000213628  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  65.71 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  65.71 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3921  30S ribosomal protein S12  64.76 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0275  30S ribosomal protein S12  64.76 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000516158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0316  30S ribosomal protein S12  64.76 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000103775  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  58.54 
 
 		 125 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  58.87 
 
 		 125 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0837  ribosomal protein S12  70.3 
 
 		 124 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.443392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  59.35 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0310  30S ribosomal protein S12  58.87 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00417807  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  64.42 
 
 		 123 aa  144  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  60 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  60 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4551  30S ribosomal protein S12  58.06 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187962  normal  0.158783 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  62.62 
 
 		 137 aa  144  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1863  30S ribosomal protein S12  58.4 
 
 		 124 aa  144  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000968975  normal  0.252117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  59.35 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  58.62 
 
 		 128 aa  144  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  59.68 
 
 		 133 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0355  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 		 126 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00057  30S ribosomal protein S12  64.76 
 
 		 124 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002297  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  64.76 
 
 		 124 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000970736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  58.54 
 
 		 125 aa  144  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  60 
 
 		 124 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  58.4 
 
 		 125 aa  144  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3538  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.3416399999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03193  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000163524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0371  ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.72822e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3645  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3718  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000740519  normal  0.0746879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3644  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000993601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4651  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000289179  normal  0.0331168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3816  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000929578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  59.35 
 
 		 125 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4281  30S ribosomal protein S12  57.48 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000473434  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3759  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000474528  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03144  hypothetical protein  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000164791  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3623  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000437781  hitchhiker  0.00102152 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  66.04 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3811  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000707874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3753  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00207543  normal  0.0353577 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  59.35 
 
 		 134 aa  143  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3716  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000501374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0714  30S ribosomal protein S12  58.73 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0371  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000085622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3914  30S ribosomal protein S12  57.94 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  63.46 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  58.54 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  57.26 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  58.54 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0416  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00364585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  57.72 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  63.81 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  58.87 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  66.04 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0621  ribosomal protein S12  58.73 
 
 		 123 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0467971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4553  30S ribosomal protein S12  58.73 
 
 		 123 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  56.8 
 
 		 124 aa  142  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  60 
 
 		 123 aa  142  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  63.3 
 
 		 125 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  57.14 
 
 		 123 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0832  30S ribosomal protein S12  57.94 
 
 		 123 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08790  30S ribosomal protein S12  57.94 
 
 		 123 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.762272  normal  0.0106283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  64.08 
 
 		 135 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  66.99 
 
 		 123 aa  141  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  58.06 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  64.15 
 
 		 124 aa  141  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0332  30S ribosomal protein S12  63.21 
 
 		 124 aa  142  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.75443e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0600  30S ribosomal protein S12  57.26 
 
 		 124 aa  141  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00583114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  61.9 
 
 		 124 aa  141  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  58.26 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 124 aa  141  5e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06190  30S ribosomal protein S12  57.14 
 
 		 123 aa  141  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529309  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  64.08 
 
 		 137 aa  141  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  56.52 
 
 		 145 aa  141  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  62.86 
 
 		 136 aa  141  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  58.06 
 
 		 123 aa  141  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  58.87 
 
 		 135 aa  141  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>